结论：相邻权并不因超过三年时效而当然不适用，但超过诉讼时效可能会影响您通过法律途径主张权利的效果。具体来说，如果邻居在公共区域砌围墙并朝您方开一侧门的行为持续存在，且该行为确实侵犯了您的相邻权，那么您仍然有权主张相邻权，但需注意诉讼时效的问题。

详细分析：

1. 相邻权的法律基础：

   • 相邻权是指不动产的相邻各方在行使所有权或使用权时，因相互间依法应当给予方便或接受限制而发生的权利义务关系。这包括通风、采光、排水、通行等方面的权利。
   • 在您的情况下，如果邻居在公共区域砌围墙并朝您方开一侧门，且该行为影响了您的正常通行、通风或采光等，那么邻居的行为可能构成了对您相邻权的侵犯。

2. 诉讼时效的考虑：

   • 诉讼时效是指民事权利受到侵害的权利人在法定的时效期间内不行使权利，当时效期间届满时，债务人获得诉讼时效抗辩权。
   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一般诉讼时效期间为三年。但这并不意味着超过三年时效，相邻权就当然不适用。关键在于，在时效期间内，您是否积极主张了自己的权利。
   • 如果您在知道或应当知道权利被侵害之日起三年内未提起诉讼或采取其他法律措施，且邻居提出诉讼时效抗辩，那么您可能会面临败诉的风险。然而，如果邻居的行为持续存在，且您能证明该行为一直对您造成侵害，那么在某些情况下，法院可能会认为诉讼时效并未真正开始计算或已经中断。

3. 实际建议：

   • 收集证据：首先，您需要收集证据证明邻居的行为确实侵犯了您的相邻权，如照片、视频、证人证言等。
   • 与邻居协商：在采取法律措施之前，您可以尝试与邻居进行协商，看是否能够达成和解或找到其他解决方案。
   • 咨询律师：如果协商无果，您可以咨询专业律师，了解您的具体法律权益和可能的法律途径。律师可以根据您的具体情况，为您提供更详细的法律建议和诉讼策略。
   • 及时主张权利：无论采取何种方式，都建议您及时主张自己的权利，避免超过诉讼时效而面临不利后果。

特殊情况说明：

• 如果邻居的行为已经构成了对公共区域的非法占用或破坏，那么除了相邻权的问题外，还可能涉及其他法律责任，如行政处罚或刑事责任。在这种情况下，您可以向相关部门举报或报警处理。

总结： 相邻权并不因超过三年时效而当然不适用，但超过诉讼时效可能会影响您通过法律途径主张权利的效果。因此，建议您在知道或应当知道权利被侵害之日起，及时收集证据、与邻居协商、咨询律师并主张自己的权利。如果您有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。