结论是：三份合同中两份作废后，剩下的那一份是否有效，取决于该份合同本身是否满足法律规定的生效要件，以及作废的两份合同与剩余合同之间的关系。以下从不同角度进行分析：

1. 合同生效要件的角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效需要满足行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗等条件。
   • 如果剩下的那一份合同满足上述生效要件，且没有其他导致合同无效或可撤销的情形，那么该份合同是有效的。

2. 作废合同与剩余合同关系的角度：

   • 独立合同关系：如果三份合同是相互独立的，每份合同都有其独立的权利义务关系，那么其中两份合同的作废并不会影响剩下那一份合同的效力。例如，三份合同分别涉及不同的交易或事项，且彼此之间没有关联或依赖关系。
   • 关联合同关系：如果三份合同之间存在关联或依赖关系，比如一份合同是另一份合同的补充协议或附件，或者三份合同共同构成一个完整的交易安排，那么其中两份合同的作废可能会对剩下那一份合同的效力产生影响。在这种情况下，需要具体分析作废的原因、剩余合同的内容以及它们之间的逻辑关系，以确定剩余合同是否仍然有效。

3. 作废原因的角度：

   • 协商一致作废：如果两份合同是经双方当事人协商一致而作废的，且这种作废并不涉及对剩余合同效力的影响，那么剩余合同仍然有效。
   • 法定或约定作废：如果两份合同是因法定原因（如合同违法、无效等）或约定原因（如合同中约定的解除条件成就）而作废的，且这种作废对剩余合同产生了直接或间接的影响，那么需要具体分析剩余合同是否仍然满足生效要件或是否受到作废合同的影响而失效。

建议：

• 在处理此类问题时，建议首先审查剩余合同的内容，确认其是否满足法律规定的生效要件。
• 其次，分析作废的两份合同与剩余合同之间的关系，确定它们之间是否存在关联或依赖关系。
• 最后，结合作废的原因和具体情况，综合判断剩余合同的效力。

可能后果：

• 如果剩余合同有效，那么双方当事人应当继续履行合同义务，享受合同权利。
• 如果剩余合同无效或可撤销，那么双方当事人可能需要根据法律规定或合同约定承担相应的法律责任，如返还财产、赔偿损失等。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。