行政诉讼调解协议在符合法定条件的情况下是有效的。以下是对这一问题的详细分析：
一、行政诉讼调解的适用原则与例外
一般原则：
- 根据《行政诉讼法》的规定，人民法院在审理行政案件时，原则上不适用调解。这是因为行政诉讼的核心在于审查具体行政行为的合法性，行政机关代表国家依法行使职权，其行为具有法定性和强制性，不存在双方当事人自由协商的空间。
例外情况：
- 行政赔偿、补偿案件：在这类案件中，由于涉及到公民、法人或其他组织因行政行为而遭受的损失赔偿或补偿问题，赔偿、补偿的范围、方式、数额等具有一定的弹性空间。因此，当事人可以在法律规定的框架内，通过调解方式达成双方都能接受的解决方案。
- 行政机关行使自由裁量权的案件：在法律、法规规定的范围内，行政机关享有一定的自由裁量权，如在行政处罚的幅度选择、行政许可的附加条件设定等方面。这种自由裁量空间为行政机关和相对人提供了协商的可能性。通过调解，可以促使行政机关合理行使自由裁量权，同时满足相对人的合理诉求。
二、调解协议的有效性条件
自愿原则：
- 调解应当是基于双方当事人的真实意愿进行的，任何一方都不得被迫接受调解结果。这是确保调解协议有效性的基础。
合法原则：
- 调解内容必须符合法律规定，不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。这是确保调解协议合法性的重要保障。
程序合法：
- 调解过程应当遵循法定程序，包括调解的启动、进行、结束等各个环节。只有程序合法的调解协议，才能被认定为有效。
三、调解协议的法律后果
具有法律效力：
- 一旦调解协议达成并符合上述有效性条件，该协议即具有法律效力，对双方当事人具有约束力。双方当事人应当按照协议内容履行各自的义务。
可申请强制执行：
- 如果一方当事人不履行调解协议，另一方当事人可以向人民法院申请强制执行。人民法院将依法对调解协议进行审查，并作出相应的执行裁定。
四、特殊情况说明
- 在行政诉讼过程中，如果行政机关主动改变了其所作的行政行为，并且原告对此表示同意并申请撤诉，这实际上也可以视为一种“调解”的结果。这种情况下，虽然没有直接的调解过程，但行政行为的改变和原告的撤诉都是基于双方的意愿和协商达成的，同样具有法律效力。
总结与建议：
行政诉讼调解协议在符合法定条件的情况下是有效的。在实际操作中，双方当事人应当严格遵守调解的原则和程序规定，确保调解结果的公正性和合法性。如果您在行政诉讼中遇到了调解相关的问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业的法律意见和解决方案。