员工私自收款后不交公司，这是一种严重的违法行为，公司应及时采取措施来维护自身权益。以下是从民事、刑事及公司管理三个层面进行的综合分析和建议：
一、民事层面
不当得利：
- 员工无合法依据私自收取公司款项，构成不当得利。公司有权要求员工返还所收款项及相应损失，如资金占用利息等。这是基于《民法典》中关于不当得利的规定，公司作为受损方，有权要求员工返还不当得利所得。
违反劳动合同：
- 员工此行为通常违反了劳动合同或公司规章制度中的财务流程规定。公司可依据合同或规章对员工进行处罚，包括警告、罚款、解除劳动合同，并要求赔偿经济损失。例如，如果劳动合同中明确规定了员工必须将业务往来中收取的款项及时、足额上交公司，那么员工私自截留款项就构成了违约。
二、刑事层面
职务侵占罪：
- 若员工利用职务便利，将公司财物非法占为己有，且数额较大（起点为六万元），可能构成职务侵占罪。根据《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规定，犯职务侵占罪的，数额较大的处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。
挪用资金罪：
- 若员工非以非法占有为目的，而是挪用款项归个人使用或借贷他人，数额较大且超过三个月未还，或进行营利活动、非法活动，可能构成挪用资金罪。根据情节轻重，将处三年以下有期徒刑或者拘役至十年以上有期徒刑。
三、公司管理层面
立即调查：
- 公司应迅速开展内部调查，收集所有相关证据，如交易记录、沟通记录等，确保证据的真实性、完整性和合法性。这是后续处理员工违法行为的基础。
纪律处分：
- 根据公司规章制度，对违规员工进行纪律处分，如警告、罚款、停职检查或解雇等。这可以维护公司的内部秩序和规章制度。
法律追诉：
- 若员工行为涉嫌犯罪，公司应立即向公安机关报案，并考虑通过民事诉讼或仲裁途径追回被私吞的资金。在报案时，公司需要提供充分的证据来支持其指控。
预防机制：
- 加强内部控制和管理制度，确保财务制度严密性；加强员工培训和教育，提高法律意识和职业道德水平；建立监督机制，定期检查和审计员工工作，及时发现和纠正问题。这可以预防类似事件的再次发生，确保公司健康稳定发展。
总结与建议：
处理员工私自收款不上交的问题时，公司应综合考虑民事、刑事及公司管理三个层面的措施。既要坚决维护公司合法权益，又要遵守法律法规和道德规范。在采取具体行动前，建议公司先咨询专业法律人士的意见，以确保处理方式的合法性和有效性。同时，通过加强内部控制和管理制度建设，预防类似事件的再次发生。如果你或公司在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。