农村不动产确权登记证书中仅写房屋面积而不写宅基地面积，这种做法的合法性不能一概而论，需分情况讨论：

1. 若地方性法规或政策有明确规定
   根据《不动产登记暂行条例》第八条，不动产以不动产单元为基本单位进行登记，不动产单元需具有唯一编码。对于农村宅基地及房屋，若地方性法规或政策明确要求宅基地使用权面积与房屋所有权面积需分别登记（例如《土地管理法》实施细则或省级不动产登记规范中明确要求两者分列），则登记证书中仅记载房屋面积而未记载宅基地面积属于程序违法，可能影响权利人后续行使宅基地使用权（如翻建、流转、抵押等）。

2. 若地方性法规或政策未强制要求分列登记
   若地方性法规仅要求登记“不动产单元”的权属状况，而未明确要求宅基地面积与房屋面积必须分项记载（例如部分地区将宅基地与房屋视为一个整体不动产单元登记），则登记证书中仅记载房屋面积不必然违法。但需注意：

   • 登记机构需在证书中注明“宅基地使用权面积未分项登记”或类似表述，避免权利人误解；
     
   • 权利人可依据《不动产登记资料查询暂行办法》申请查询宅基地使用权面积的原始档案，确保权属清晰。

3. 实务中的风险提示
   即使地方性法规未强制要求分列登记，若登记证书中未记载宅基地面积，可能引发以下风险：

   • 权属争议：在宅基地流转、继承或征收补偿时，可能因面积记载不全导致权利范围争议；
     
   • 行政纠纷：若后续政策要求补登宅基地面积，可能因历史登记瑕疵增加行政程序成本；
     
   • 金融风险：宅基地抵押时，金融机构可能因面积记载不全拒绝受理或降低估值。

建议行动：
若您的登记证书中未记载宅基地面积，可采取以下措施：

1. 向当地不动产登记机构申请补充登记，明确宅基地使用权面积；
   
2. 查阅地方性法规或登记规范，确认是否属于必须分项登记的情形；
   
3. 保留宅基地审批文件、建房许可等原始材料，作为权属证明的补充依据。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。