结论前置：一份合同分次付款时，是可以一次性开票的，但需满足一定条件并注意潜在风险。
法律分析
发票开具的法律规定：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，在对外发生经营业务收取款项时，应向付款方开具发票。法律并未明确限制必须按收款进度分期开具发票，因此，收款方可以根据与付款方的约定，选择一次性开具涵盖全部款项的发票。
税务处理：
- 增值税：如果一次性开具了全额发票，则增值税纳税义务发生时间为开具发票的当天。这意味着，即使款项是分期收取，收款方也需确认全部的增值税纳税义务并缴纳相应税款。
- 企业所得税：企业应根据权责发生制原则确认收入，不一定与发票开具时间完全一致，但需确保收入金额能够可靠计量，成本能够可靠核算。
实务操作与双方约定
合同约定：
- 双方应在合同中明确约定开票方式和时间。例如，可以约定等全部款项付清后再开票，或者按照合同约定的其他方式开票。如果合同明确规定必须一次性开具全额发票，则分次开票可能构成违约。
- 若合同未明确约定，但双方在实际操作中达成分次开票的共识，建议在后续业务往来中补充书面协议或确认函，以明确权利和义务。
账务处理：
- 收款方在同意一次性开具发票时，应在账务处理上做好记录。具体操作为：在开具发票时，按照全额确认收入和增值税销项税额；对于尚未收到的款项，计入“应收账款”科目核算；随着款项的分期收回，逐步冲减“应收账款”。
风险提示与应对策略
收款方风险：
- 资金压力：一次性开具全额发票后，收款方即产生全额纳税义务，但款项尚未全部收回，可能面临资金压力。
- 违约风险：如付款方违约不付款，收款方虽可通过法律途径追讨，但已缴纳的税款一般不会退还，造成损失。
- 应对策略：收款方在开票前应评估付款方的信用状况，确保款项回收的可靠性；可在合同中约定违约责任和赔偿条款，以降低收款风险。
付款方风险：
- 提前支付风险：如在未付清全部款项时就取得全额发票，可能存在被要求提前支付剩余款项的风险。
- 退款复杂：如发现商品或服务存在质量问题需要退款，发票处理相对复杂。
- 应对策略：付款方应在合同中明确约定退换货条款和发票处理方式；在付款过程中应保留好相关证据，以便在出现问题时维护自己的权益。
举例说明
假设甲乙双方签订了一份设备采购合同，约定采用分期付款方式，但乙方希望一次性开具全额发票以便及时进行固定资产入账和进项税抵扣。此时，双方可以在合同中明确约定：“甲方同意乙方在合同签订后一次性开具全额发票，但甲方需按照合同约定的分期付款计划按时支付款项。如甲方违约未按时支付款项，乙方有权要求甲方立即支付剩余款项，并承担违约责任。”
综上所述，一份合同分次付款时一次性开票是合法且可行的，但双方应明确约定开票方式和时间，并遵循相关税收法规。同时，双方应充分评估潜在风险并采取相应的应对策略，以确保交易的顺利进行。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。