个人商铺租赁给分公司是合法的。以下从不同角度为你详细分析：
法律角度
合同主体资格：
- 分公司虽然不具有独立的法人资格，但它是总公司的一个分支机构，依法设立并领取营业执照的分公司，可以以自己的名义从事民事活动，包括签订租赁合同。因此，从合同主体资格上看，个人将商铺租赁给分公司是合法的。
合同效力：
- 只要租赁合同是双方真实意思的表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且不存在欺诈、胁迫等情形，该租赁合同就是有效的。个人与分公司签订的租赁合同，在满足上述条件的情况下，同样具有法律效力。
实际操作角度
租赁合同签订：
- 在签订租赁合同时，应明确租赁物的名称、数量、用途、租赁期限、租金及其支付期限和方式、租赁物维修等条款。这些条款的明确有助于保障双方的权益，避免后续产生纠纷。
- 特别需要注意的是，由于分公司不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，在签订合同时，可以要求总公司提供担保或确认分公司有权签订并履行该合同。
租金支付与发票开具：
- 分公司作为承租方，应按照合同约定的期限和方式支付租金。个人作为出租方，应依法开具租金发票，以便分公司进行财务处理和税务申报。
- 如果分公司未能按时支付租金，个人有权依据合同约定要求分公司支付租金及违约金，甚至可以解除合同并要求分公司承担违约责任。
租赁物使用与维护：
- 分公司应按照合同约定的用途使用租赁物，并负责租赁物的日常维护和保养。如果因分公司使用不当或故意损坏租赁物，个人有权要求分公司进行修复或赔偿。
风险提示
分公司经营状况：
- 由于分公司不具有独立的法人资格，其经营状况直接受到总公司的影响。如果总公司出现经营困难或破产等情况，分公司的租金支付能力可能会受到影响。因此，在签订租赁合同时，个人应对总公司的经营状况进行一定的了解和评估。
合同解除与违约责任：
- 如果因分公司违约导致合同解除，个人有权要求分公司承担违约责任并赔偿损失。但需要注意的是，由于分公司不具有独立的法人资格，其民事责任最终由总公司承担。因此，在追究违约责任时，可能需要将总公司作为共同被告或第三人。
建议：在将个人商铺租赁给分公司时，务必签订详细的租赁合同，并明确双方的权利和义务。同时，对总公司的经营状况进行一定的了解和评估，以降低租赁风险。如果在租赁过程中遇到任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。