关于您提出的“签订了房屋永久居住权协议但没有办理房屋居住权登记，协议是否有法律效益”的问题，这确实是一个涉及法律效力和实际操作的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：
一、协议的法律效力基础
首先，我们需要明确的是，房屋永久居住权协议在符合法律规定和特定条件时，是具有法律效力的。这包括协议双方必须具备完全民事行为能力、意思表示真实、内容合法且不违反社会公共秩序和善良风俗，以及采用书面形式订立等基本要求。
二、未办理居住权登记的影响
然而，关键在于，根据《中华人民共和国民法典》的规定，设立居住权不仅需要签订书面合同，还必须向登记机构申请居住权登记。这是确保居住权法律效力的关键步骤。如果您只签订了协议而没有办理登记，那么虽然居住权协议本身可能仍然有效（即协议内容在双方之间产生约束力），但居住权并未有效设立。这意味着，在法律上，您并不能直接享有对房屋的居住权，该权利不能对抗善意第三人，比如房屋的所有权人如果将房屋出售给第三方，第三方可能不受您居住权协议的约束。
三、实际操作中的建议
及时办理居住权登记：为了确保您的居住权得到法律保护，我强烈建议您在签订协议后，尽快向登记机构申请居住权登记。这是保障您权益的最有效方式。
合理约定居住期限：虽然协议中可以约定永久居住权，但双方仍需对居住权的期限进行合理约定，并明确居住权消灭的条件和程序。这有助于避免未来因期限问题产生纠纷。
咨询专业律师：在签订协议前，我建议您咨询专业律师，对协议内容进行详细的法律审查和咨询。律师可以帮助您确保协议内容的合法性、真实性和有效性，并为您提供关于居住权登记、期限约定等方面的专业建议。
四、特殊情况下的考虑
如果由于某些特殊原因（如房屋所有权人拒绝配合办理登记等）导致您无法办理居住权登记，那么您可能需要考虑通过法律途径来维护自己的权益。在这种情况下，律师的专业意见和协助将尤为重要。
综上所述，虽然签订了房屋永久居住权协议，但如果没有办理居住权登记，那么居住权并未有效设立。为了确保您的权益得到法律保护，我建议您尽快办理居住权登记，并在签订协议前咨询专业律师。希望这些解答能对您有所帮助。