借款金额与到账金额不符本身并不直接决定其合法性，关键在于双方是否有合法、明确的约定，以及是否存在违反法律法规的行为。以下是对此问题的详细分析：

合法情况

1. 预先扣除合理费用：

   • 在某些合法借贷中，双方可能会在借款合同中明确约定，出借方在发放借款时预先扣除一部分合理费用，如手续费、管理费等。只要这些费用在法律允许范围内，并且双方对此有明确的约定，那么这种情况是合法的。例如，双方约定借款10万元，但出借方因办理借款手续需要扣除1000元手续费，实际到账9.9万元，只要这一约定在合同中明确且合法，就不构成违法。

2. 合同明确约定差异：

   • 如果借款合同中详细说明了借款金额与到账金额的差异，并且该约定是双方真实意思表示，不违反法律强制性规定，那么这种情况也是合法的。比如，双方约定借款金额为10万元，但考虑到某些因素（如风险准备金），实际到账金额为9.5万元，并在合同中明确说明了这一差异及其原因。

违法情况

1. 砍头息与非法侵占：

   • “砍头息”是指放贷人在放贷时先扣除一部分款项作为利息，导致实际借款金额低于合同约定。这种行为往往与非法的民间借贷活动相关联，可能涉及诈骗、敲诈勒索等犯罪。例如，双方约定借款10万元，但出借方实际只发放8万元，却要求借款人按照10万元偿还本金和利息，这就构成了砍头息，是违法的。
   • 如果出借人通过欺骗、隐瞒等手段使借款人签订借款合同，并故意让到账金额少于借款金额，以非法占有为目的，则可能构成非法侵占或诈骗。

2. 未事先告知的扣除：

   • 若借款方在未事先告知借款人的情况下扣除利息或费用，导致到账金额与借款金额不符，且未经借款人同意，这种行为可能构成违约，侵犯了借款人的合法权益。例如，出借方在发放借款时未经借款人同意就扣除了部分款项作为利息或费用，导致借款人实际收到的金额少于合同约定。

3. 虚假诉讼：

   • 出借方若故意虚报借款金额，或通过不正当手段导致借款金额与到账金额不符，并以此为由提起诉讼，可能构成虚假诉讼罪。这种行为不仅妨害了司法秩序，还严重侵害了他人的合法权益。

处理建议

1. 仔细审查合同：

   • 在签订借款合同时，双方应仔细审查合同条款，确保借款金额与到账金额一致，或有明确的扣除说明。如果发现不一致或存在模糊条款，应及时与对方协商修改或重新签订合同。

2. 保留相关证据：

   • 借款人应妥善保存转账记录、收据、借款合同等相关证据。这些证据在发生纠纷时将起到至关重要的作用，能够证明自己的权益和对方的违约行为。

3. 积极寻求法律援助：

   • 如果无法协商解决纠纷，借款人应积极寻求法律援助。可以通过咨询专业律师、向法律援助机构申请帮助或提起诉讼等方式来维护自己的合法权益。

综上所述，借款金额与到账金额不符的合法性需根据具体情况判断。在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并采取适当的法律措施来维护自身权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。