工伤认定中止通知书对用人单位确实存在影响，但这种影响主要体现在程序层面，而非直接对用人单位的权利义务产生实质性改变。以下从多个角度详细分析：
一、程序层面的影响
暂停认定进程：工伤认定中止通知书意味着劳动保障行政部门（或社会保险行政部门）因特定法定情形（如需要有关部门的事故结论、存在劳动关系争议、不可抗力等）而暂时停止了工伤认定程序。这对用人单位而言，意味着工伤认定的结果将暂时无法确定，可能影响到用人单位对工伤事故的后续处理决策。
延长处理时间：由于工伤认定程序的中止，用人单位可能需要等待更长时间才能得知工伤认定的结果。这可能会影响到用人单位对工伤职工的医疗救治、工伤赔偿等事宜的安排。
二、实体层面的潜在影响（虽不直接，但需关注）
劳动关系确认：如果工伤认定中止是因为劳动者与用人单位之间存在劳动关系争议，那么用人单位需要积极参与劳动仲裁或诉讼，以确认劳动关系。这一过程可能对用人单位的用工管理、人力资源配置等产生一定影响。
赔偿准备：虽然工伤认定中止本身不直接决定用人单位的赔偿责任，但一旦工伤认定程序恢复并最终认定为工伤，用人单位可能需要承担相应的工伤赔偿责任。因此，在中止期间，用人单位可以提前准备相关赔偿事宜，如了解赔偿标准、准备赔偿资金等。
三、法律建议与应对措施
积极配合调查：用人单位在收到工伤认定中止通知书后，应积极配合劳动保障行政部门的调查工作，提供必要的证据和资料，以尽快恢复工伤认定程序。
关注中止情形变化：用人单位应密切关注导致工伤认定中止的情形变化，如有关部门的事故结论是否出具、劳动关系争议是否解决等。一旦中止情形消失，应及时向劳动保障行政部门申请恢复工伤认定程序。
咨询专业律师：如果用人单位对工伤认定中止通知书的内容或处理方式存在疑问，可以咨询专业律师，以了解自身权利义务和应对策略。作为专注于劳动纠纷领域的律师，我可以为你提供详细的法律咨询和帮助。
四、典型案例参考
案例：某建筑公司员工在工地受伤，但未签订劳动合同，公司否认劳动关系。社保部门受理工伤认定申请后，因劳动关系存疑发出《工伤认定中止通知书》。建筑公司积极配合劳动仲裁，最终确认了劳动关系。社保部门恢复工伤认定程序后，认定该员工为工伤，建筑公司依法承担了工伤赔偿责任。
分析：此案例中，工伤认定中止通知书对建筑公司的影响主要体现在程序层面，即工伤认定结果的暂时不确定。但建筑公司通过积极配合劳动仲裁，最终确认了劳动关系，恢复了工伤认定程序，并依法承担了赔偿责任。这表明，用人单位在面对工伤认定中止时，应积极应对，以维护自身合法权益。
综上所述，工伤认定中止通知书对用人单位的影响主要体现在程序层面，但用人单位仍需关注其实体层面的潜在影响，并采取相应的应对措施。如果你有任何关于工伤认定或劳动纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。