关于母子公司之间五万元付款能否抵消的问题，这并非一个简单的“能”或“不能”的答案，而是需要依据具体的法律关系和事实情况来判断。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 合同关系角度：

   • 如果母子公司之间存在明确的合同关系，且合同中规定了付款和抵消的相关条款，那么五万元的付款能否抵消就需要依据合同的具体内容来判断。
   • 若合同中明确规定了双方之间的付款可以相互抵消，且五万元的付款符合抵消的条件（如金额相等、到期、无争议等），那么这五万元的付款是可以抵消的。
   • 若合同中没有相关规定，或者规定不明确，那么就需要依据《中华人民共和国民法典》中关于合同履行和抵消的相关规定来判断。

2. 法律规定角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第五百六十八条：“当事人互负债务，该债务的标的物种类、品质相同的，任何一方可以将自己的债务与对方的到期债务抵销；但是，根据债务性质、按照当事人约定或者依照法律规定不得抵销的除外。”
   • 这意味着，如果母子公司之间的债务符合上述条件，即种类、品质相同，且没有不得抵消的情形，那么五万元的付款是可以抵消的。
   • 但需要注意的是，如果债务性质特殊（如涉及人身损害赔偿、税收等），或者当事人之间有特别约定不得抵消，那么就不能进行抵消。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，母子公司之间的付款抵消往往涉及到复杂的财务和税务处理。
   • 即使法律上允许抵消，也需要考虑抵消后的财务影响、税务处理以及是否符合公司内部的财务管理制度等因素。
   • 因此，在实际操作中，建议母子公司之间在抵消付款前，先进行充分的沟通和协商，并咨询专业的财务和税务顾问的意见。

总结与建议：

• 母子公司之间五万元的付款能否抵消，取决于具体的合同关系、法律规定以及实际操作情况。
• 如果双方之间有明确的合同规定，且符合法律规定的抵消条件，那么可以进行抵消。
• 如果没有合同规定或者规定不明确，建议先咨询专业的法律顾问，了解具体的法律要求和操作流程。
• 在实际操作中，还需要考虑财务和税务处理等因素，确保抵消的合法性和合规性。

如果你有更具体的法律关系或事实情况需要了解，或者对上述分析有任何疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细的法律解答。