公司合同签补充协议是否需要通过员工，这主要取决于补充协议的内容以及原合同的性质。以下从不同角度为你详细分析：
如果补充协议内容不涉及员工权益：
- 例如，补充协议是关于公司之间合作细节的调整、供货价格的变动（且这些变动不直接影响员工薪酬或工作条件）等，那么通常不需要通过员工。因为这类补充协议主要调整的是公司之间的权利义务关系，与员工个人无直接关联。
如果补充协议内容涉及员工权益：
- 劳动合同的补充协议：若原合同是劳动合同，且补充协议涉及员工的薪酬、工作时间、工作地点、福利待遇等核心条款的变更，那么根据《劳动合同法》的相关规定，公司应当与员工协商一致，并签订书面的变更协议。这是因为劳动合同的变更直接影响到员工的切身利益，必须得到员工的同意。
- 其他涉及员工权益的合同：即使原合同不是劳动合同，但如果补充协议的内容涉及到员工的权益（如员工持股计划、奖金分配方案等），公司也应当遵循公平、公正、公开的原则，与员工进行充分沟通，并在必要时取得员工的同意。
特殊情况下的考虑：
- 集体合同：如果公司有签订集体合同，且补充协议的内容涉及到集体合同中约定的员工权益，那么公司还需要与工会或职工代表进行协商，并按照集体合同的规定程序进行变更。
- 法律法规的强制性规定：无论补充协议的内容如何，公司都必须遵守国家法律法规的强制性规定。如果补充协议的内容违反了法律法规，那么该协议将是无效的，且公司可能面临法律责任。
法律建议：
- 在签订补充协议前，公司应当仔细审查原合同的内容以及补充协议可能涉及的法律条款，确保补充协议的合法性和有效性。
- 如果补充协议涉及员工权益，公司应当与员工进行充分沟通，解释补充协议的内容及其可能对员工产生的影响，并在必要时取得员工的同意。
- 公司可以咨询专业律师，以确保补充协议的签订过程符合法律法规的要求，并避免潜在的法律风险。
可能后果：
- 如果公司未经员工同意擅自签订涉及员工权益的补充协议，员工有权向劳动争议仲裁委员会或法院提起诉讼，要求确认补充协议无效或撤销补充协议中涉及员工权益的部分。
- 公司还可能因违反法律法规而面临行政处罚或民事赔偿等法律责任。
综上所述，公司合同签补充协议是否需要通过员工，取决于补充协议的内容以及原合同的性质。在涉及员工权益的情况下，公司应当谨慎处理，并遵循相关法律法规的规定。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。