针对您提出的“把钱打给对方公司员工，纠纷起诉个人还是公司”的问题，这并非一个非此即彼的简单选择，而是需要根据具体情况来综合判断。以下是我从不同角度为您进行的分析：

1. 如果员工的行为构成表见代理：

   • 表见代理定义：表见代理是指行为人虽无代理权，但因被代理人的行为造成了足以使善意相对人相信其有代理权的表象，而与善意相对人进行的、由本人承担法律后果的代理行为。
   • 法律后果：在此情况下，即使员工实际上没有代理权，但如果您有理由相信该员工有权代表公司收款（例如，员工出示了公司授权文件、公司之前有过类似交易且由该员工处理等），那么您的付款行为可能被视为对公司有效，纠纷发生时，您可能更倾向于起诉公司。

2. 如果员工的行为不构成表见代理，但构成职务行为：

   • 职务行为定义：职务行为通常指工作人员在执行职务过程中实施的行为，这些行为在外观上与职务相关，且通常是为了公司的利益。
   • 法律后果：如果员工收款是出于执行职务的需要，且该行为在公司授权范围内或属于员工职责范围内，那么即使员工个人没有明确的收款权限，公司也可能需要承担相应责任。在此情况下，您同样可能选择起诉公司。

3. 如果员工的行为既不构成表见代理，也不构成职务行为：

   • 法律后果：如果员工收款完全是其个人行为，与公司无关，且您没有理由相信该员工有权代表公司收款，那么纠纷发生时，您可能需要直接起诉该员工个人，要求其返还款项或承担其他法律责任。

4. 特殊情况考虑：

   • 公司追认：如果公司事后追认了员工的收款行为，那么该行为将被视为对公司有效，您可能需要起诉公司。
   • 员工与公司共同责任：在某些情况下，如果员工与公司存在共同过错或共同行为导致纠纷发生，您可能需要同时起诉员工和公司，要求他们承担连带责任。

在处理此类纠纷时，我建议您采取以下步骤：

• 收集证据：包括转账记录、聊天记录、授权文件等，以证明您的付款行为以及对方员工收款的行为性质。
• 咨询专业律师：由于此类纠纷涉及复杂的法律关系和证据认定，我建议您在采取任何法律行动前咨询专业律师，以便更准确地判断纠纷性质并制定合适的诉讼策略。
• 考虑和解或调解：在诉讼前，您可以尝试与对方公司或员工进行和解或调解，以节省时间和成本并达成双方都能接受的解决方案。

最后，我想强调的是，每个案件都有其独特性，因此上述分析仅供参考。在处理具体纠纷时，请务必根据案件事实和法律规定来综合判断并采取合适的法律行动。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。