结论：民事判决生效四十年后，即便有新证据证明原判决认定事实错误，一般情况下也无法直接申请再审，但存在特殊情形可能允许再审申请。以下从法律规定、申请再审的期限限制、特殊情形等方面进行详细分析：
法律规定与申请再审的期限限制
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审。
申请再审的期限限制：
- 通常情况下，当事人申请再审的期限为判决、裁定发生法律效力后六个月内。这是为了维护法律关系的稳定性和裁判的权威性，避免案件长期处于不确定状态。
- 在特定情形下，如当事人有新的证据，足以推翻原判决、裁定的，或者原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的，或者据以作出原判决、裁定的法律文书被撤销或者变更的，以及审判人员审理该案件时有贪污受贿，徇私舞弊，枉法裁判行为的，当事人可以在知道或者应当知道该情形之日起六个月内提出再审申请。但即便如此，也并未规定可以突破判决生效后长期的时间限制，如四十年。
特殊情形分析
新证据的特殊性：
- 虽然新证据是申请再审的重要理由之一，但新证据的出现并不意味着可以无限期地申请再审。法律对申请再审的期限有明确规定，这是为了平衡当事人的申诉权与法律关系的稳定性。
- 如果新证据是在判决生效后很长时间才发现的，且该新证据对案件结果有重大影响，理论上当事人可以尝试申请再审，但实践中可能会因超过申请再审的期限而被驳回。
司法实践中的考量：
- 在司法实践中，法院会综合考虑多种因素来决定是否受理再审申请，包括但不限于新证据的证明力、对原判决的影响程度、申请再审的期限是否已过等。
- 对于判决生效四十年后的案件，由于时间跨度大，证据可能已灭失或难以收集，且法律关系可能已发生多次变更，因此法院在受理再审申请时会更加谨慎。
特殊救济途径：
- 在极少数情况下，如果当事人能够证明原判决存在重大错误，且该错误对当事人的合法权益造成了严重损害，且无法通过其他途径得到救济，法院可能会考虑启动再审程序。但这需要当事人提供充分的证据和理由，并经过法院的严格审查。
建议
- 及时行使权利：当事人应在判决生效后及时关注案件情况，如有新证据或发现原判决存在错误，应在法定期限内及时申请再审。
- 咨询专业律师：对于涉及复杂法律问题的案件，建议当事人咨询专业律师，以获取更准确的法律意见和帮助。
- 考虑其他救济途径：如果再审申请因期限问题被驳回，当事人可以考虑通过其他途径寻求救济，如申诉、信访等（但需注意这些途径并非法律程序，其效果和保障程度可能有限）。
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