综合行政执法局已认定违建的，通常会根据违建的性质、情节轻重及社会危害程度，依法采取责令限期拆除、没收违法所得或违法建筑物、罚款等行政处罚措施，具体处理方式如下：

1. 责令限期拆除：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
   • 处理流程：综合行政执法局在认定违建后，会向违建当事人发出《责令限期拆除决定书》，明确要求当事人在规定期限内自行拆除违建。若当事人在规定期限内未自行拆除，综合行政执法局可能会依法采取强制拆除措施。

2. 没收违法所得或违法建筑物：

   • 适用情形：对于无法采取改正措施消除对规划实施影响的违建，或者违建当事人逾期不拆除且经催告后仍不履行拆除义务的，综合行政执法局可以依法没收违法所得或违法建筑物。
   • 处理流程：在作出没收决定前，综合行政执法局会进行充分的调查取证，确保没收决定的合法性和合理性。没收决定作出后，会依法进行公告，并告知违建当事人享有复议和诉讼的权利。

3. 罚款：

   • 法律依据：除了上述提到的《中华人民共和国城乡规划法》外，其他相关法律法规也可能对违建行为规定罚款措施。例如，《中华人民共和国土地管理法》第七十七条、第七十八条等条款，对非法占用土地进行建设的行为规定了罚款等处罚措施。
   • 处理流程：综合行政执法局在认定违建后，会根据违建的性质、情节轻重及社会危害程度，依法确定罚款数额，并向违建当事人发出《行政处罚决定书》，明确要求当事人在规定期限内缴纳罚款。

4. 其他措施：

   • 查封施工现场：在违建建设过程中，综合行政执法局可以依法查封施工现场，防止违建继续扩大或造成更大危害。
   • 强制执行：若违建当事人逾期不履行拆除义务或缴纳罚款义务，且经催告后仍不履行的，综合行政执法局可以依法向人民法院申请强制执行。

在处理违建问题时，综合行政执法局会遵循以下原则：

• 依法行政：严格按照法律法规的规定进行认定和处理，确保程序的合法性和结果的公正性。
• 公正公开：在处理过程中保持公正态度，确保当事人的合法权益得到保障；同时，将处理结果及时公开，接受社会监督。
• 教育与处罚相结合：在处罚违建行为的同时，注重对当事人的教育引导，提高其法律意识，防止类似行为再次发生。

若您对综合行政执法局的处理决定有异议，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。在处理过程中，建议您积极配合综合行政执法局的工作，主动履行相关义务，以减少不必要的法律纠纷和损失。