关于“协议工厂档案是否要本人去办理”的问题，这主要取决于具体的档案管理服务机构和办理流程的要求，不过我可以根据一般的流动人员人事档案管理规定来给您一个较为全面的解答。
首先，我们需要明确的是，流动人员人事档案的管理和服务通常是由县级以上（含县级）人民政府设立的公共就业和人才服务机构，以及经省级人力资源社会保障行政部门授权的单位来负责的。这些机构提供了一系列的服务，包括档案的接收、转递、整理、保管，以及依据档案记载出具相关证明等。
针对您的问题，是否需要本人亲自去办理协议工厂档案的相关手续，这并没有一个绝对的答案。因为不同的档案管理服务机构可能有不同的办理流程和要求。有些机构可能允许委托他人代办，只需要提供相关的委托书和代办人的身份证明即可；而有些机构则可能要求本人必须亲自到场办理。
为了获取最准确的信息，我建议您采取以下步骤：
联系档案管理服务机构：首先，您需要联系您所在地区或协议工厂所在地的档案管理服务机构，了解他们的具体办理流程和要求。
咨询办理方式：在联系机构时，您可以直接询问是否需要本人亲自去办理，以及如果允许委托他人代办，需要提供哪些材料和手续。
准备相关材料：根据机构的要求，准备好相关的身份证明、委托书（如果需要的话）以及其他可能需要的材料。
按照流程办理：最后，按照机构提供的流程和要求，前往办理或委托他人代办相关手续。
总的来说，虽然不同的档案管理服务机构可能有不同的要求，但通过与机构直接联系并咨询，您可以获取到最准确和最新的信息，从而确保您能够顺利地办理协议工厂档案的相关手续。希望这个解答能够对您有所帮助！如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。