年初三考勤12小时是否算加班需分情况讨论，具体结论如下：

1. 若年初三属于法定节假日
   根据《全国年节及纪念日放假办法》，春节假期包含3天法定节假日（通常为初一、初二、初三）。若年初三属于法定假日，则当日工作性质为法定假日加班，无论工作时长是否超过8小时，均需按日工资的300%支付加班费，且不得以调休替代。
   法律依据：《劳动法》第44条第3项规定，法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的300%的工资报酬。

2. 若年初三属于休息日（调休或周末）
   若年初三因调休被纳入周末休息日范围，则当日工作性质为休息日加班。此时需分两种情形：

   • 工作时长≤8小时：按日工资的200%支付加班费；
     
   • 工作时长＞8小时：超出部分按日工资的150%（即1.5倍）支付延长工时加班费，同时8小时内的部分仍按200%计算。
     法律依据：《劳动法》第44条第2项规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬；《工资支付暂行规定》第13条补充了延长工时的计算标准。

3. 若年初三属于正常工作日（无调休）
   若年初三未被纳入法定假日或休息日范围（如企业自行安排工作），则当日工作性质为正常工作日延长工时。此时需满足两个条件：

   • 每日工作时间超过8小时；
     
   • 每月总工时超过法定标准（通常为176小时/月）。
     符合条件时，超出部分按日工资的150%支付加班费。
     法律依据：《劳动法》第44条第1项规定，安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的150%的工资报酬。

实务建议：

• 劳动者需保留考勤记录、工资条等证据，若企业未依法支付加班费，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁；
  
• 企业应提前通过规章制度或劳动合同明确加班计算规则，避免因标准模糊引发纠纷。
  

如有具体案例细节（如劳动合同约定、企业考勤制度等），可进一步向我咨询以精准分析。