自行建立的协议，村里盖章了，是否具有法律效力，需根据具体情况综合判断。以下从多个角度进行分析：
一、协议具有法律效力的基本条件
主体适格：
- 协议双方或多方当事人必须具备相应的民事行为能力。在农村土地或宅基地相关协议中，流转方和受让方都应是具有完全民事行为能力的自然人、法人或其他组织。若一方或双方不具备民事行为能力，协议可能因主体不适格而无效。
意思表示真实：
- 协议内容必须是各方当事人基于真实意愿的表达，不存在欺诈、胁迫或重大误解等情形。若村里在违背真实意思的情况下盖章，如因被欺诈或胁迫而盖章，该协议可被撤销，撤销后自始不具有法律效力。
内容合法：
- 协议内容必须严格遵守法律法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的合法权益，也不得违背公序良俗。例如，若协议涉及将农村集体土地擅自用于非农建设且未经法定审批程序，此类协议因违反土地管理法等法律法规的强制性规定而无效。
形式合规：
- 虽然农村实践中可能存在形式不够规范的情况，但原则上，协议应尽可能符合法律规定的形式要求。对于涉及重要权益的协议，如农村土地承包经营权流转协议，建议采用书面形式，并可考虑进行公证，以进一步增强其法律效力。
签字盖章的有效性：
- 协议上的签字盖章人必须具有代表权或授权。村里盖章时，应确保盖章人员具有代表村里签订协议的权限，如村长或村民代表。若由无授权人员签字盖章，可能影响协议的法律效力。
二、协议可能不具有法律效力的情形
违反法律强制性规定：
- 如前所述，若协议内容违反法律法规的强制性规定，如擅自改变土地用途，该协议将无效。
损害集体或他人利益：
- 若协议签订过程中存在为少数人私利而损害村集体大多数成员利益或第三人合法权益的情况，该协议可能被认定为无效或可撤销。
存在欺诈、胁迫等情形：
- 如一方通过欺诈手段使村里在违背真实意思的情况下盖章签订协议，或通过胁迫手段迫使村里盖章，此类协议可被撤销。
三、法律建议
审查协议内容：
- 在签订协议前，应仔细审查协议内容，确保其符合法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的合法权益，也不违背公序良俗。
确认签字盖章人员的权限：
- 确保签字盖章人员具有代表村里签订协议的权限，避免因无授权人员签字盖章而影响协议的法律效力。
考虑采用书面形式并进行公证：
- 对于涉及重要权益的协议，建议采用书面形式，并可考虑进行公证，以进一步增强其法律效力。
及时咨询法律专业人士：
- 若对协议的法律效力存在疑问，或协议内容涉及复杂法律问题，建议及时咨询法律专业人士，如律师，以获取专业法律意见。
总结来说，自行建立的协议村里盖章了是否具有法律效力，需根据协议的主体适格性、意思表示真实性、内容合法性、形式合规性以及签字盖章的有效性等多个方面进行综合判断。若您对协议的法律效力存在疑问，或需要进一步了解相关法律问题，请直接向我咨询。