自然人之间车辆牌照挂靠协议的效力问题，需结合具体情况分析，一般而言，若协议内容不违反法律强制性规定，且双方意思表示真实，则协议有效；但若存在规避法律、损害公共利益等情形，则可能无效。以下从不同角度进行详细分析：

协议有效的情形

1. 双方意思表示真实：如果自然人之间签订的车辆牌照挂靠协议是双方真实意思的表示，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响，且协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该协议通常是有效的。例如，双方约定将车辆牌照挂靠在某一方名下，以便另一方能够使用该牌照进行合法运营，且双方均明确知晓并同意这一安排，同时协议中明确规定了双方的权利和义务，这样的协议在法律上是被认可的。

2. 不违反法律强制性规定：协议内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果协议只是涉及车辆牌照的挂靠使用，而没有涉及其他违法活动，如非法运营、逃税等，那么该协议在法律上是有效的。

协议无效的情形

1. 规避法律或损害公共利益：如果自然人之间签订的车辆牌照挂靠协议是为了规避法律、行政法规的强制性规定，或者损害国家、集体或第三人的利益，那么该协议是无效的。例如，双方通过挂靠协议来逃避车辆购置税、车船税等税费，或者利用挂靠协议进行非法运营活动，这样的协议在法律上是无效的。

2. 以合法形式掩盖非法目的：如果协议表面上看似合法，但实际上是为了掩盖非法目的而签订的，那么该协议也是无效的。例如，双方通过签订车辆牌照挂靠协议来掩盖非法转让、出租车辆牌照的行为，这样的协议同样在法律上是无效的。

法律建议

1. 谨慎签订协议：在签订车辆牌照挂靠协议前，双方应充分了解协议内容，确保协议内容合法、合规，且双方意思表示真实。如有必要，可以咨询专业律师的意见，以确保协议的合法性和有效性。

2. 明确双方权利和义务：协议中应明确规定双方的权利和义务，包括车辆牌照的使用范围、使用期限、费用支付方式等，以避免后续产生纠纷。

3. 遵守法律法规：双方应严格遵守国家法律法规和行政法规的规定，不得利用挂靠协议进行违法活动。如有违法行为，将承担相应的法律责任。

如有任何关于车辆牌照挂靠协议的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。