当集资公司老板跑路时，员工确实会面临诸多困境，但别担心，我们可以采取一系列措施来保护自己的权益并协助司法机关进行调查。以下是我为您整理的一份详细指南：
一、立即采取行动，报案并配合调查
迅速报案：非法集资属于刑事犯罪，一旦发现老板跑路，您应第一时间向当地公安机关报案。这有助于警方及时介入，减少经济损失，并有可能追回被骗资金。
提供详细信息：在报案时，尽量详细地陈述您所了解的公司运营情况、业务模式、工作职责以及与非法集资相关的具体细节。这些信息对司法机关快速掌握案件情况至关重要。
积极配合询问：在司法机关调查过程中，如实回答问题，不隐瞒或编造事实。如果可能，提供老板可能的藏匿地点、资金去向等关键线索。
二、收集并保存所有相关证据
出资证明：妥善保存所有与非法集资相关的出资证明文件，如合同、收据、转账记录等。这些证据在后续的理赔和追诉过程中将发挥关键作用。
其他证据：除了出资证明，还应收集公司宣传资料、会议记录、聊天记录等其他与非法集资有关的证据。这些证据有助于更全面地了解案件情况。
三、关注警方申报通告，及时办理申报手续
警方在调查过程中可能会发布申报通告，要求受害者申报损失。您应密切关注这些通告，并按照要求及时办理申报手续。这样，在警方成功追回赃款后，您才能获得相应的赔偿。
四、评估自身法律责任，寻求专业法律意见
咨询律师：尽快寻求专业律师的帮助，详细介绍自己在公司的工作情况，包括入职时间、工作岗位、薪资待遇等，以及是否参与了非法集资的核心环节。
区分责任：根据律师的建议，评估自己是否需要承担刑事责任。一般员工如果未直接参与非法集资业务活动，且对公司行为并不知情，通常不需要承担刑事责任。而业务相关员工则可能根据其在犯罪中的作用、参与程度等因素来判断责任。
五、维护自身合法权益，追讨工资和其他权益
工资追讨：通过合法途径追讨被拖欠的工资，如向劳动争议调解组织申请调解，或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如果仲裁结果不满意，还可以向法院申请强制执行。
其他权益：关注社会保险、住房公积金等其他权益问题，并向相关部门反映情况，要求公司依法补缴。
六、加强法律意识，防范未来风险
提高警惕：在日常生活中提高警惕，避免参与任何非法集资活动。了解非法集资的特征和危害，增强自我保护意识。
学习法律知识：加强法律知识的学习，了解自己的权益和义务。这样，在面对类似情况时，您就能更加从容地应对。
七、考虑后续职业发展
在维权的同时，也不要忽视自己的职业发展。整理个人职业资料，总结工作经验和技能，积极寻找新的工作机会。可以通过网络招聘平台、人才市场等多种渠道来寻找适合自己的工作。
总之，当集资公司老板跑路时，员工应保持冷静，积极采取行动来保护自己的权益。通过报案、收集证据、关注警方通告、评估法律责任、维护合法权益以及加强法律意识等措施，我们可以更好地应对这一困境，并为自己的未来做好规划。