结论：车租出去拉违禁品过了三年，一般情况下难以申请刑事附带民事赔偿，但具体还需结合案件实际情况判断。以下从多个角度进行分析：
一、刑事附带民事赔偿的适用条件
刑事附带民事赔偿是指在刑事诉讼过程中，被害人由于被告人的犯罪行为而遭受物质损失的，在刑事诉讼过程中，有权提起附带民事诉讼，要求被告人赔偿经济损失。其适用条件主要包括：
- 存在犯罪行为：即被告人的行为必须构成犯罪，这是提起刑事附带民事赔偿的前提。
- 被害人遭受物质损失：即被害人的损失必须是物质性的，如财产损失、医疗费用等，不包括精神损失。
- 损失与犯罪行为有因果关系：即被害人的物质损失必须是由被告人的犯罪行为直接造成的。
二、本案的具体情况分析
犯罪行为的认定：
- 如果租车人使用租赁的车辆运输违禁品，且该行为被认定为犯罪（如走私、贩卖毒品等），则满足了刑事附带民事赔偿的第一个条件。
被害人遭受物质损失：
- 作为车主，您可能因车辆被用于犯罪活动而遭受车辆被扣押、损坏或价值贬损等物质损失。
损失与犯罪行为的因果关系：
- 您需要证明您的物质损失是由租车人的犯罪行为直接造成的。这通常需要提供相关证据，如车辆损坏的照片、维修记录、车辆价值评估报告等。
诉讼时效问题：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。虽然刑事附带民事赔偿的诉讼时效可能因刑事案件的审理而有所中断或延长，但一般情况下，如果自您知道或应当知道权利受到损害之日起超过三年，且没有诉讼时效中断或延长的法定事由，您可能面临诉讼时效届满的风险。
- 特殊情况：如果租车人的犯罪行为属于连续或继续状态，或者您在三年内曾向租车人主张过权利（如要求赔偿、报警等），则诉讼时效可能从中断或重新计算之日起算。
三、建议与措施
收集证据：
- 尽快收集与车辆损坏、价值贬损等相关的证据，如照片、维修记录、评估报告等。
- 保留与租车人的租赁合同、沟通记录等，以证明租车关系及租车人的违约行为。
咨询专业律师：
- 由于刑事附带民事赔偿的案件涉及刑事和民事两个领域，且诉讼时效问题复杂，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 律师可以帮助您评估案件的可行性、制定诉讼策略，并代表您参与诉讼过程。
考虑其他救济途径：
- 如果刑事附带民事赔偿的诉讼时效已届满或难以证明损失与犯罪行为的因果关系，您可以考虑通过民事诉讼途径向租车人主张违约责任或侵权责任。
- 您还可以向相关部门（如公安机关、交通运输管理部门）举报租车人的违法行为，以维护社会公共利益和自身合法权益。
最后，每个案件的具体情况都有所不同，因此建议您在采取任何行动前咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。