您好，关于退赃款后的处理问题，这确实是一个涉及法律程序和规定的重要环节。我将结合相关法律知识和实际案例，为您详细解答。
首先，退赃款的处理主要依据的是刑法及相关司法解释的规定。在受贿案件中，如果受贿人已经将赃款退还给了行贿人，或者受贿人及其家属主动退赃，那么这些赃款的处理方式将取决于具体的案件情况和法律规定。
一、退赃款给行贿人的情况
如果受贿人在案发前已经将赃款退还给了行贿人，那么在处理时，通常会考虑行贿人是否构成犯罪以及赃款的性质。
行贿人构成犯罪：如果行贿人因为谋取不正当利益而给予受贿人财物，且该财物属于行贿人用于行贿犯罪的财物，那么即使受贿人已经将赃款退还，该财物仍然应当依法予以没收。此时，监察机关或司法机关会扣押行贿人主动退出的赃款。
行贿人不构成犯罪：如果行贿人是因为被勒索而给予受贿人财物，且没有获得不正当利益，那么行贿人不构成犯罪。在这种情况下，如果受贿人已经将赃款退还给了行贿人，那么该财物实际上属于行贿人的合法财产，应当及时返还给行贿人。
二、受贿人及其家属主动退赃的情况
如果受贿人或其家属在案发后主动退赃，那么这些赃款的处理方式将取决于受贿人是否构成犯罪以及退赃的时间点。
受贿人构成犯罪：如果受贿人构成犯罪，且其或其家属主动退赃，那么这些赃款应当依法予以追缴。在追缴过程中，如果受贿人已经将部分赃款退还给了行贿人，那么监察机关或司法机关会根据实际情况，扣押行贿人主动退出的赃款（如果行贿人构成犯罪），同时对于受贿人或其家属主动退出的其他赃款，也会依法进行追缴。
退赃时间点的影响：根据“两高”《关于办理受贿刑事案件适用法律若干问题的意见》的规定，如果国家工作人员收受请托人财物后及时退还或者上交的，不是受贿。这意味着，如果受贿人在收受财物后短时间内主动退还，且没有受贿故意，那么这些财物不会被认定为受贿所得，也就不需要追缴。但是，如果受贿人是在受贿既遂后，因自身或者与其受贿有关联的人、事被查处，为掩饰犯罪而退还或者上交的，那么不影响认定受贿罪，退还的财物仍然需要追缴。
三、实际案例解析
以您提供的案例为例，李某作为受贿人，在案发前已经将部分赃款退还给了行贿人张某。在案发后，李某的妻子又代为退赃40万元。根据法律规定和案件情况，监察机关最终扣押了张某主动退出的赃款20万元（因为张某构成行贿罪），同时对于李某妻子代为退赃的40万元，解除了对其中20万元的扣押措施（因为这部分赃款李某已经退还给了张某，且张某已经构成犯罪并被扣押了相应赃款），退还给了李某妻子。
综上所述，退赃款后的处理方式取决于多种因素，包括行贿人是否构成犯罪、受贿人是否构成犯罪、退赃的时间点等。如果您或您身边的人遇到了类似问题，建议及时咨询专业律师或相关司法机关，以便得到更准确、更具体的法律帮助。