在民事诉讼中，非法调取证据的认定机关主要是人民法院。以下是对这一问题的详细分析：
一、认定机关
在民事诉讼过程中，如果一方当事人认为对方调取的证据存在非法性，如通过窃听、偷拍、威胁、利诱等非法手段获取，可以向人民法院提出异议。人民法院在审理案件时，会依法对证据的合法性进行审查。如果证据确实是通过非法手段获取的，人民法院将依法排除该证据，即不予采信。
二、认定依据
法律规定：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，证据必须合法取得，才能作为认定案件事实的依据。非法证据，如通过侵犯他人合法权益或违反法律禁止性规定的方法取得的证据，不得作为认定案件事实的根据。
审查标准：
- 人民法院在审查证据时，会综合考虑证据的收集方式、手段、目的以及是否侵犯了他人的合法权益等因素。如果证据的收集过程存在违法行为，或者证据本身与案件事实无关联，或者证据的真实性、合法性存疑，人民法院将不予采信。
三、非法证据的后果
证据排除：
- 一旦证据被认定为非法，人民法院将依法排除该证据，即该证据不得作为认定案件事实的依据。
法律责任：
- 如果非法调取证据的行为构成犯罪，如非法侵入住宅罪、侵犯公民个人信息罪等，相关责任人还可能承担刑事责任。同时，非法调取证据的行为也可能违反行政法规，面临行政处罚。
四、建议与提醒
合法取证：
- 在民事诉讼中，当事人应依法取证，避免使用非法手段获取证据。合法取证不仅有助于维护自身权益，也有助于维护司法公正和权威。
及时异议：
- 如果当事人认为对方调取的证据存在非法性，应及时向人民法院提出异议，并提供相关证据或线索支持自己的主张。
咨询专业律师：
- 在涉及复杂证据问题时，建议当事人咨询专业律师，以获取更具体、更专业的法律建议。
如果您在民事诉讼中遇到非法调取证据的问题，或者对证据的合法性有疑问，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况，提供全面、准确的法律建议。