法人自己保管公章并在借据上盖章，这一行为在法律上通常是有效的，但具体效力需结合多种因素综合判断。以下是从不同角度进行的详细分析：

1. 公章的法律效力：

   • 公章是法人身份的重要象征，具有法律效力。在法律上，公章的使用通常被视为法人意志的体现。因此，当法人自己保管公章并在借据上盖章时，这一行为在形式上符合法人行为的特征。

2. 法人行为的合法性：

   • 法人作为独立的法律主体，有权进行民事法律行为，包括签订借据等合同。只要法人具备相应的民事行为能力，且盖章行为是其真实意思的表示，那么该行为就是合法的。
   • 在此情况下，法人自己保管公章并盖章，并不违反法律法规的强制性规定，也不损害国家、集体或第三人的利益，因此该行为是有效的。

3. 借据内容的合法性：

   • 除了盖章行为本身外，借据的内容也必须合法。如果借据中的条款违反了法律法规的强制性规定，或者存在欺诈、胁迫等情形，那么即使法人盖章，该借据也可能被认定为无效。
   • 因此，在判断法人盖章的借据是否有效时，还需要对借据的内容进行审查。

4. 可能存在的风险点：

   • 内部管理风险：虽然法人自己保管公章并盖章在法律上可能是有效的，但从内部管理角度来看，这可能存在风险。例如，如果法人未经授权或违反公司章程规定擅自使用公章，可能会引发内部纠纷或法律责任。
   • 外部交易风险：在与外部交易时，如果对方对法人盖章的真实性或合法性存在疑虑，可能会要求提供额外的证明材料或进行更严格的审查。这可能会增加交易成本或影响交易效率。

5. 法律建议：

   • 完善内部管理：法人应建立健全的公章管理制度，明确公章的保管、使用、审批等流程，确保公章的使用符合法律法规和公司章程的规定。
   • 谨慎使用公章：法人在使用公章时应谨慎行事，确保盖章行为是其真实意思的表示，并避免在未经授权或违反规定的情况下使用公章。
   • 审查借据内容：在签订借据时，法人应仔细审查借据的内容，确保条款合法、合规，并避免存在欺诈、胁迫等情形。

总结来说，法人自己保管公章并在借据上盖章，在法律上通常是有效的，但具体效力需结合公章使用的合法性、借据内容的合法性以及可能存在的风险点进行综合判断。如果你在实际操作中遇到相关问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。