结论：农村自建房无法过户但有合同的情况下，合同本身具有一定的法律效力，但可能因房屋性质、土地性质等因素导致合同履行存在障碍或风险。以下从多个角度进行详细分析：
一、合同效力角度
合同成立与生效：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。只要合同双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同即成立并生效。
- 农村自建房买卖合同，如果双方自愿签订，且内容合法，通常具有法律效力。
合同履行障碍：
- 尽管合同有效，但由于农村自建房可能涉及宅基地使用权等特殊性质，导致房屋无法过户。宅基地使用权是农村集体经济组织成员享有的权利，非本集体经济组织成员一般不得取得。
- 如果买方非本集体经济组织成员，即使签订了买卖合同，也可能因违反土地管理法规而无法办理过户手续。
二、法律风险角度
合同无效风险：
- 如果农村自建房买卖合同违反了法律、行政法规的强制性规定，如未经集体经济组织同意擅自转让宅基地使用权，合同可能被认定为无效。
- 合同无效后，双方应返还因合同取得的财产，有过错的一方应赔偿对方因此受到的损失。
履行不能风险：
- 即使合同有效，如果因政策、法律等原因导致房屋无法过户，买方可能面临无法取得房屋所有权的风险。
- 在此情况下，买方可以要求卖方承担违约责任，如赔偿损失、支付违约金等。但具体责任承担方式需根据合同约定和实际情况确定。
三、实践建议角度
审查合同条款：
- 在签订农村自建房买卖合同时，应仔细审查合同条款，确保合同内容合法、明确，并约定好违约责任和争议解决方式。
- 特别注意合同中关于房屋过户的条款，明确双方的权利和义务。
了解房屋性质：
- 在购买农村自建房前，应了解房屋的性质、土地性质以及是否可以过户等信息。
- 可以咨询当地土地管理部门或房地产管理部门，以获取准确的信息。
谨慎交易：
- 鉴于农村自建房交易的复杂性和风险性，建议买方在交易前进行充分的调查和了解，必要时可寻求专业律师的帮助。
- 如果房屋无法过户，买方应谨慎考虑是否继续交易，并评估可能面临的风险和损失。
进一步思考：农村自建房买卖涉及的法律问题较为复杂，不仅涉及合同效力问题，还涉及土地管理法规、房地产登记制度等多个方面。因此，在进行农村自建房买卖时，应充分了解相关法律法规和政策规定，确保交易的合法性和安全性。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。