核心结论：在已就过期食品进行赔偿后，消费者后期称因食用该过期食品导致拉肚子并要求进一步赔偿，商家需根据不同情况采取相应措施，具体如下：
核实消费者拉肚子与食用过期食品的因果关系
- 要求消费者提供证据：商家应要求消费者提供医疗证明，如医院的诊断书、病历、检查报告等，以证明其拉肚子是由食用该过期食品直接导致的。因为拉肚子可能由多种原因引起，如自身肠胃疾病、食用其他不洁食物等，仅消费者口头声称难以确定因果关系。
- 进行内部调查：商家自身也需要对涉事过期食品进行调查，查看同批次食品是否有类似问题反馈，以及食品的储存、销售环节是否存在可能导致食品变质的其他因素。例如，检查仓库的温湿度是否符合食品储存要求，销售过程中食品是否有受到污染的可能等。
根据因果关系确定责任及赔偿方式
- 若能证明因果关系成立：
- 协商赔偿：商家应与消费者进行协商，根据消费者实际遭受的损失，如医疗费用、误工费、护理费等进行合理赔偿。赔偿范围应基于实际产生的费用，且有相关票据支持。例如，消费者因拉肚子就医花费了500元医疗费，产生了200元误工费，那么商家在协商时可考虑赔偿这700元。
- 签订赔偿协议：在协商达成一致后，双方应签订赔偿协议，明确赔偿金额、赔偿方式、赔偿时间等条款，以避免后续产生纠纷。协议应具有法律效力，双方签字盖章后各执一份。
- 若无法证明因果关系成立：
- 拒绝不合理赔偿要求：商家可以向消费者解释无法证明拉肚子与食用过期食品之间的因果关系，因此不能承担额外的赔偿责任。但要注意沟通方式，避免与消费者产生冲突。
- 建议消费者通过合法途径解决：如果消费者坚持认为商家应负责，商家可以建议消费者通过消费者协会调解、向市场监管部门投诉或者向人民法院提起诉讼等合法途径解决争议。在消费者采取这些途径时，商家应积极配合相关部门的调查和处理。
预防类似事件再次发生
- 加强食品管理：商家要进一步完善食品的进货查验、储存保管、销售记录等制度，确保食品在各个环节的质量安全。定期对库存食品进行检查，及时清理过期食品，防止过期食品再次流入市场。
- 提高员工意识：对员工进行食品安全法律法规和操作规范的培训，提高员工的食品安全意识和责任意识，确保员工在食品销售过程中严格遵守相关规定。