在行政诉讼中，如果被告（通常是行政机关）超过举证期限提出证据，原告可以从以下几个角度提出反驳理由：
违反法定程序：
- 法律依据：根据《中华人民共和国行政诉讼法》及相关司法解释，被告应当在法定的举证期限内提交证据，这是行政诉讼的基本程序要求。
- 反驳理由：被告超过举证期限提交证据，违反了法定程序，剥夺了原告及时质证和辩论的权利，影响了案件的公正审理。因此，该证据应被视为无效或不被采纳。
证据失权原则：
- 法律原则：在诉讼中，当事人应当遵循诚实信用原则，按时提交证据。超过举证期限提交证据，是对诉讼秩序的破坏，应承担相应的法律后果。
- 反驳理由：根据证据失权原则，被告因自身原因未在举证期限内提交证据，应视为放弃举证权利，该证据不得在后续诉讼中被使用。
影响案件公正审理：
- 诉讼效果：行政诉讼的目的是解决行政争议，保护公民、法人和其他组织的合法权益。如果允许被告随意超过举证期限提交证据，将破坏诉讼的平衡，影响案件的公正审理。
- 反驳理由：被告超过举证期限提交的证据，可能使原告在诉讼中处于不利地位，无法充分准备反驳意见，从而损害了原告的合法权益。因此，为了维护诉讼的公正性和效率，该证据应被排除。
具体案例与司法实践：
- 案例参考：在司法实践中，法院通常会严格审查被告提交证据的时间，对于超过举证期限的证据，除非有正当理由（如不可抗力等），否则一般不予采纳。
- 反驳策略：原告可以引用相关案例，说明法院在处理类似情况时的态度和做法，从而增强自己反驳理由的说服力。
强调举证期限的重要性：
- 诉讼效率：举证期限的设置是为了保证诉讼的顺利进行，提高诉讼效率。如果允许被告随意超过举证期限提交证据，将导致诉讼拖延，增加当事人的诉讼成本。
- 反驳重点：原告可以强调举证期限的重要性，指出被告超过举证期限提交证据是对诉讼效率的破坏，也是对原告权益的不尊重。因此，该证据应被视为无效。
综合建议：
- 在行政诉讼中，原告应密切关注被告提交证据的时间，确保在举证期限内对被告的证据进行充分质证和辩论。
- 如果被告超过举证期限提交证据，原告应及时向法院提出异议，并阐述上述反驳理由，以维护自己的合法权益。
- 原告还可以咨询专业律师（即我本人，郑学滨律师，专注于房屋拆迁、土地纠纷、行政纠纷等领域），获取更具体的法律建议和策略，以便更好地应对行政诉讼中的各种情况。