若商标行政诉讼判决商标局重新作出决定，商标局及当事人需按以下步骤处理，具体分为两种情况：

1. 商标局需依法重新审查并作出决定
   根据《行政诉讼法》第七十一条，若法院判决撤销原行政行为（如驳回商标注册申请、宣告商标无效等），并责令商标局重新作出行政行为，商标局必须：
   
   • 重新审查事实与证据：不得以同一事实和理由作出与原决定基本相同的结论（除非补充新证据或依据新法律）；
     
   • 遵循法定程序：如重新公告、听取当事人陈述申辩等；
     
   • 在法定期限内完成：通常为收到判决后3个月内，具体以《商标法实施条例》规定为准。
     

示例：若原决定因“缺乏显著性”驳回申请，但法院认为商标局未充分说明理由，商标局需重新评估显著性，可能要求申请人补充使用证据或直接核准注册。

1. 当事人可采取的应对措施
   
   • 监督商标局重新决定：若商标局未依法重新审查（如拖延、重复原决定），当事人可：
     
     • 向法院申请强制执行；
       
     • 提起行政复议或再次诉讼，主张商标局不作为或违法；
       
   • 补充证据或主张权利：在重新审查阶段，当事人可提交新证据（如商标使用证明、市场调查数据）支持其主张；
     
   • 关注期限与权利救济：若对重新决定仍不服，可在收到决定后15日内起诉或60日内申请复议。
     

关键点：法院判决仅针对原行政行为的合法性，不直接判定商标是否应注册，因此重新决定的结果仍需商标局独立审查。

建议：若您涉及此类案件，可提供判决书及商标局重新决定的文书，我将进一步分析商标局是否依法履行义务，并制定后续维权策略。