结论：在专利授权两年后因未交年费失效，但在专利维持期间发现有人侵权的情况下，您一般不能直接起诉侵权人，但存在一些特殊情况和补救措施可以考虑。以下从多个角度为您详细分析：
一、专利失效后的法律状态
专利失效后，该专利技术即进入公有领域，任何人都可以自由使用，无需再获得专利权人的许可，也不存在侵权问题。因此，从法律状态上看，一旦专利失效，您就失去了就该专利技术主张侵权赔偿的权利。
二、侵权行为发生的时间点
侵权行为发生在专利有效期内：
- 如果侵权行为确实发生在专利有效期内，但由于您当时未及时发现或未采取法律措施，导致现在专利已经失效，这确实是一个遗憾的情况。
- 在这种情况下，虽然您现在不能直接起诉侵权人，但如果您能证明侵权行为确实发生在专利有效期内，并且您当时因某种原因（如未及时发现、未准备充分等）未能及时起诉，您可以考虑与侵权人进行协商，看是否能够达成某种补偿协议。不过，这种协商的成功率可能较低，因为侵权人可能会利用专利已经失效的情况来拒绝赔偿。
侵权行为持续至专利失效后：
- 如果侵权行为在专利有效期内开始，并持续至专利失效后，情况就更为复杂。
- 对于专利有效期内的侵权部分，您理论上仍有权主张赔偿，但由于专利已经失效，实际操作中可能面临诸多困难。
- 对于专利失效后的侵权部分，由于专利技术已进入公有领域，您则无权主张赔偿。
三、特殊情况和补救措施
专利恢复程序：
- 如果专利失效是由于未按时缴纳年费导致的，且失效时间不长（通常在一定期限内，如几个月内），您可以考虑申请专利恢复程序。
- 专利恢复程序需要满足一定的条件，并缴纳相应的费用。如果成功恢复专利，您就可以重新获得专利权，并有权对之前的侵权行为提起诉讼。
- 但需要注意的是，专利恢复程序的成功率并非百分之百，且需要满足严格的条件。此外，即使专利成功恢复，对于已经失效期间内的侵权行为，您可能仍需要证明侵权行为确实发生在专利有效期内，并且您当时因某种原因未能及时起诉。
寻求其他法律救济途径：
- 如果专利无法恢复，且您认为侵权行为给您造成了重大损失，您可以考虑寻求其他法律救济途径，如不正当竞争诉讼等。
- 不正当竞争诉讼通常要求证明侵权人存在恶意或不当行为，且该行为给您造成了实际损失。这可能需要您提供充分的证据来支持您的主张。
四、建议与总结
及时咨询专业律师：
- 鉴于专利法律问题的复杂性，我建议您及时咨询专业律师，以便更准确地评估您的案件情况和可能的法律救济途径。
保留相关证据：
- 无论您选择哪种法律救济途径，都需要保留充分的证据来支持您的主张。这包括专利证书、年费缴纳记录、侵权行为证据等。
考虑未来保护策略：
- 此次经历也应促使您考虑未来的专利保护策略。例如，您可以加强专利监测和维权意识，及时发现并制止侵权行为；或者考虑申请多项相关专利，形成专利组合，以增强您的市场竞争力。
总结：虽然专利失效后您一般不能直接起诉侵权人，但存在一些特殊情况和补救措施可以考虑。我建议您及时咨询专业律师，评估您的案件情况，并考虑采取适当的法律救济途径来维护您的合法权益。如果您有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。