医疗机构通过非法渠道购进药品，主要由药品监督管理部门进行管理。以下从多个角度为你详细分析：

1. 管理部门的职责：

   • 药品监督管理部门是负责药品监管的主要机构，其职责包括确保药品的来源合法、质量可靠，以及打击非法购进、销售药品等违法行为。当医疗机构通过非法渠道购进药品时，药品监督管理部门将依法进行调查和处理。

2. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国药品管理法》的相关规定，药品上市许可持有人、药品经营企业以及医疗机构，均必须从具有药品生产、经营资格的企业购进药品（未实施审批管理的中药材除外）。这一规定为药品监督管理部门打击非法购进药品行为提供了明确的法律依据。

3. 可能的法律后果：

   • 如果医疗机构通过非法渠道购进药品，药品监督管理部门将依法责令其改正，并没收违法购进的药品以及违法所得。同时，根据违法情节的轻重，医疗机构还可能面临罚款、吊销执业许可等行政处罚。若非法购进的药品导致患者人身损害等严重后果，医疗机构及相关责任人还可能承担民事赔偿责任乃至刑事责任。

4. 实际操作中的建议：

   • 医疗机构应严格遵守药品管理法律法规，从正规渠道购进药品，并确保药品的质量和患者的用药安全。同时，应加强内部管理，建立完善的药品采购、验收、使用等制度，确保每一步都符合法律规定。此外，定期对员工进行药品管理法律法规的培训，提高员工的法律意识和合规意识，也是预防类似违法行为发生的有效措施。

5. 患者权益保护：

   • 如果患者因医疗机构非法购进药品而受到损害，有权向药品监督管理部门投诉举报，并要求医疗机构承担相应的赔偿责任。在维权过程中，患者可以寻求法律援助或咨询专业律师，以更好地维护自己的合法权益。

作为翟晓静律师，我专注于医疗纠纷领域，如果你在医疗纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。