诊所通过非法渠道购进药品是严重的违法行为，针对这一问题，卫健局（或相关药品监管部门）会依据《中华人民共和国药品管理法》等相关法律法规进行严肃处理。以下是具体的处理方式和法律后果：
一、责令改正与没收
责令改正：卫健局会首先要求诊所立即停止非法购进药品的行为，并明确指示诊所必须从具有药品生产、经营资格的企业合法采购药品。
没收违法药品：执法人员会依法收缴诊所通过非法渠道购进的全部药品，以防止这些药品继续流通使用，从而保障患者的用药安全。
二、没收违法所得与罚款
没收违法所得：如果诊所在使用或销售非法购进药品过程中有获利，这些违法所得将被全部没收，以体现法律的公正性和威慑力。
罚款：根据违法情节的轻重，诊所将面临不同幅度的罚款。一般情况下，罚款金额为违法购进药品货值金额的二倍以上十倍以下。若情节严重，如多次违法或导致严重药品安全事故，罚款金额将提高至货值金额的十倍以上三十倍以下。
三、吊销执业许可与停业整顿
吊销执业许可：在情节特别严重的情况下，诊所的医疗机构执业许可证书将被吊销，这意味着诊所将失去合法开展医疗活动的资格，对其经营造成重大打击。
停业整顿：除了吊销执业许可外，诊所还可能被责令停业整顿，以进一步纠正其违法行为，并确保其整改到位后再重新开业。
四、民事赔偿与刑事责任
民事赔偿：如果非法购进的药品存在质量问题，导致患者人身损害等严重后果，诊所及相关责任人不仅需要承担民事赔偿责任，赔偿患者的医疗费用、误工费等损失。
刑事责任：在情节严重的情况下，诊所及相关责任人还可能因触犯刑法而被追究刑事责任。例如，可能构成生产、销售假药罪或生产、销售劣药罪等，面临刑事处罚。
五、建议与防范措施
为避免上述法律风险，诊所等医疗机构应严格遵守药品管理法律法规，从正规渠道购进药品，并确保药品的质量和患者的用药安全。同时，应加强内部管理，建立完善的药品采购、验收、使用等制度，确保每一步都符合法律规定。此外，定期对员工进行药品管理法律法规的培训，提高员工的法律意识和合规意识，也是预防类似违法行为发生的有效措施。
综上所述，卫健局对诊所非法渠道购进药品的行为将依法进行严肃处理，包括责令改正、没收违法药品及违法所得、罚款、吊销执业许可等行政处罚，并可能追究民事赔偿责任乃至刑事责任。因此，诊所等医疗机构应严格遵守相关法律法规，确保药品的合法来源和质量安全。