针对您提出的“员工删除自己的程序怎么办”这一问题，这确实是一个涉及法律责任和职业道德的重要议题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，员工在未经公司同意的情况下擅自删除自己所编程序的源代码（或任何工作成果），这一行为可能构成对公司财产权的侵害，并可能对公司造成经济损失。根据相关法律法规和司法实践，这种行为是否需要承担民事赔偿责任，主要取决于以下几个因素：

1. 职务属性：

   • 如果员工编写源代码是职务行为，即该行为是公司业务的一部分，且员工在编写过程中使用了公司的资源（如设备、时间、信息等），那么员工对自己所编程序的源代码并不拥有完全的自主权。在这种情况下，擅自删除源代码可能构成对公司财产的侵害。

2. 经济损失：

   • 员工擅自删除源代码后，如果公司能够证明这一行为导致了实际的经济损失（如项目延期、客户流失、修复成本等），那么公司有权要求员工承担相应的民事赔偿责任。

3. 法律责任：

   • 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，侵害他人财产的，应当承担民事赔偿责任。在员工擅自删除源代码的情况下，如果这一行为被认定为侵害公司财产权，员工可能需要赔偿公司因此遭受的直接和间接经济损失。

4. 职业道德：

   • 除了法律责任外，员工擅自删除工作成果还涉及职业道德问题。这种行为可能损害公司的声誉和利益，破坏团队氛围，甚至影响公司的正常运营。因此，即使从职业道德的角度出发，员工也应该避免这种行为的发生。

具体建议：

• 预防措施：公司应建立健全的源代码管理制度，明确员工对源代码的权限和责任。同时，加强员工职业道德教育，提高员工对保护公司财产权的意识。

• 应对措施：如果发生员工擅自删除源代码的情况，公司应首先尝试与员工沟通，了解原因并寻求解决方案。如果沟通无果，公司可以收集相关证据（如源代码删除记录、经济损失证明等），并考虑通过法律途径维护自身权益。

• 法律途径：在必要时，公司可以向法院提起诉讼，要求员工承担民事赔偿责任。法院将根据具体情况（如职务属性、经济损失、法律责任等）进行判决。

案例参考：

• 您可以参考北京海淀法院公布的“离职擅自删源代码被判赔”案例。在该案例中，程序员因擅自删除自己所编程序的源代码而被法院判决赔偿公司经济损失6万元。这一案例具有警示意义，提醒员工要尊重公司财产权，避免类似行为的发生。

综上所述，员工擅自删除自己的程序（特别是源代码）可能构成对公司财产权的侵害，并需要承担相应的民事赔偿责任。因此，建议员工在工作中要遵守公司规章制度和职业道德规范，避免这种行为的发生。同时，公司也应加强管理和教育，提高员工的法律意识和职业道德水平。