若劳动者与用人单位已明确协商工资标准，在劳动仲裁中，仲裁庭通常会依据双方协商一致的工资标准进行判决，但需结合具体证据和实际情况综合判定。以下分情况详细说明：

1. 双方协商一致且有充分证据支持
   若劳动者能提供书面劳动合同、工资条、录用通知书、邮件、聊天记录等证据，证明双方已就工资标准达成明确约定（如具体金额、支付方式、支付时间等），且用人单位未提出合理抗辩（如劳动者存在重大过失、违反规章制度等导致工资调整的情形），仲裁庭一般会支持劳动者主张的工资标准，判决用人单位按约定支付工资及可能的差额、经济补偿等。

2. 协商一致但证据存在瑕疵
   若双方虽口头协商一致，但缺乏书面证据，或证据存在模糊、矛盾（如工资条未明确标注基数、口头约定与实际发放不符等），仲裁庭可能结合以下因素综合判定：

   • 行业惯例：参考同行业、同岗位的工资水平；
     
   • 实际履行情况：若用人单位长期按某一标准发放工资，劳动者未提出异议，可能视为双方对工资标准的实际认可；
     
   • 公平原则：若工资标准明显低于当地最低工资标准或显失公平，仲裁庭可能调整至合理范围。

3. 用人单位主张工资标准已变更
   若用人单位主张双方已通过协商变更工资标准（如降薪），需承担举证责任，证明：

   • 变更的合法性：如劳动者同意降薪的书面协议、因经营困难需调整工资的股东会决议等；
     
   • 变更的合理性：降薪幅度是否符合比例原则，是否与劳动者的工作表现、岗位价值匹配；
     
   • 程序的合规性：是否履行民主程序（如涉及集体降薪）或告知劳动者（如单方降薪需提前通知）。
     若用人单位无法充分举证，仲裁庭可能不支持其主张，仍按原协商标准判决。

4. 特殊情形下的工资标准认定

   • 试用期工资：若协商的试用期工资低于约定转正工资的80%或当地最低工资标准，仲裁庭可能按法定标准调整；
     
   • 加班工资基数：若协商的工资标准未明确包含加班工资基数，仲裁庭可能以劳动合同约定的工资、集体合同标准或实际发放工资的70%作为基数；
     
   • 病假、工伤等特殊期间工资：若协商标准低于法定标准（如病假工资不低于最低工资的80%），仲裁庭可能按法定标准判决。

建议：若您面临此类纠纷，需重点收集以下证据：

1. 证明工资标准约定的证据（如劳动合同、录用通知）；
   
2. 证明工资实际发放情况的证据（如银行流水、工资条）；
   
3. 证明用人单位存在违法情形的证据（如未足额支付、单方降薪通知）。
   

如有进一步疑问，可直接向我咨询，我将结合您的具体情况提供详细分析。