结论：军人正在看病时部队下了退役命令，这一行为是否合法，需结合具体情况及相关法律法规来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

1. 退役命令的合法性基础

   • 根据《中华人民共和国兵役法》及相关军事法规，军人的退役通常需遵循一定的程序和条件，包括服役年限、健康状况、军队建设需要等多方面因素。若军人因达到法定退役条件（如服役期满、身体原因无法继续服役等），且退役程序符合规定，那么部队下达退役命令是合法的。
   • 在军人正在看病的情况下，如果其病情已经严重到无法继续履行军人职责，且经过医疗鉴定确认，那么部队根据相关规定下达退役命令，也是合法的。

2. 看病期间下达退役命令的特殊性

   • 军人正在看病，可能处于治疗或康复阶段。此时下达退役命令，需特别考虑军人的健康状况和医疗需求。如果退役命令的下达没有充分考虑军人的健康状况，或者违反了相关的医疗保障规定，那么这一行为可能涉嫌违法。
   • 例如，如果军人因公受伤正在接受治疗，且治疗尚未结束，部队在此期间下达退役命令，可能违反了《军人抚恤优待条例》中关于因公致残军人医疗保障和退役安置的规定。

3. 程序正当性的考量

   • 退役命令的下达需遵循正当程序，包括通知军人本人、听取其意见、进行医疗鉴定（如需要）、报请上级批准等环节。如果部队在下达退役命令时未遵循这些程序，或者程序存在瑕疵，那么这一行为的合法性也会受到质疑。

4. 具体案例分析

   • 在实际操作中，每个案例都有其独特性。例如，有的军人可能因长期患病无法继续服役，部队在评估其健康状况后下达退役命令；而有的军人则可能因临时生病正在接受治疗，部队却在此期间下达了退役命令。这两种情况在合法性上可能存在显著差异。

建议：

• 如果军人或其家属认为部队下达的退役命令不合法，可以首先与部队进行沟通，了解退役命令的具体依据和程序。
• 如果沟通无果，可以向上级军事机关或相关部门提出申诉，要求重新审查退役命令的合法性。
• 在申诉过程中，建议军人或其家属咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。

可能法律后果：

• 如果退役命令被确认违法，部队可能需要撤销该命令，并恢复军人的原职或给予相应的补偿。
• 如果退役命令合法，但军人或其家属认为处理过程中存在不当行为，也可以通过法律途径寻求救济，如提起行政诉讼等。

总之，军人正在看病时部队下了退役命令是否合法，需结合具体情况及相关法律法规来判断。如有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。