结论：法拍评估农村厂房未卖出时，垫付的评估费是否退还，需根据拍卖程序的具体进展、相关合同约定以及法律规定来综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 拍卖程序未完成前的费用承担：

   • 在拍卖程序正式开始前，若因各种原因（如拍卖公告发布后无人报名、拍卖前发现厂房存在权属争议等）导致拍卖未能进行，此时评估费通常应视为拍卖前的必要准备费用。
   • 根据《中华人民共和国拍卖法》及相关司法实践，若拍卖未能进行非因买受人原因，且拍卖合同或相关协议中未明确约定评估费由哪方承担，则该费用一般应由委托拍卖方（即厂房的所有者或相关权利人）承担。

2. 拍卖程序进行中但未成交的费用承担：

   • 若拍卖程序已经启动，包括发布了拍卖公告、进行了拍卖展示等，但最终因无人出价或出价未达到保留价等原因导致拍卖未成交，此时评估费的承担需依据拍卖合同或相关协议的约定。
   • 若合同或协议中明确约定了拍卖未成交时评估费的承担方式，则应按照约定执行。若未明确约定，则可能需要根据公平原则，由委托拍卖方和拍卖机构协商分担，或根据实际情况判断哪方应承担主要责任。

3. 合同或协议中的特别约定：

   • 在实际操作中，委托拍卖方和拍卖机构可能会在拍卖合同或相关协议中就评估费的承担作出特别约定。这些约定可能包括：无论拍卖是否成交，评估费均由委托拍卖方承担；或拍卖成交后由买受人承担，未成交则由委托拍卖方承担等。
   • 因此，在判断评估费是否应退还时，应首先审查拍卖合同或相关协议中的相关条款。

4. 法律救济途径：

   • 若因评估费退还问题产生争议，且无法通过协商解决，委托拍卖方或拍卖机构可以向人民法院提起诉讼，要求对方承担评估费或退还已支付的评估费。
   • 在诉讼过程中，法院将根据拍卖合同或相关协议的约定、拍卖程序的具体进展以及相关法律法规的规定，综合判断评估费的承担方。

建议：

• 在参与法拍评估前，委托拍卖方应与拍卖机构明确约定评估费的承担方式，并在拍卖合同或相关协议中予以明确。
• 若拍卖未成交且产生评估费退还争议，建议首先与拍卖机构进行协商，尝试通过友好方式解决争议。
• 若协商无果，可考虑向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自身权益。

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