合法建造事实物权与登记生效原则的关系，可以总结为：合法建造事实物权在特定条件下可以独立于登记生效原则而存在，但在涉及物权变动或处分时，仍需遵循登记生效原则。以下是对这一关系的详细解释：
一、合法建造事实物权的独立性
合法建造事实物权，指的是因合法建造房屋等事实行为而设立或消灭的物权。根据不动产物权登记生效原则的例外规定，因合法建造、拆除房屋等事实行为而设立或消灭的物权，自这些事实行为成就时即发生效力。这意味着，在房屋合法建造完成时，建造者即取得该房屋的所有权，无需等待办理过户登记。这一规定体现了法律对事实行为的认可和保护，确保了建造者的合法权益。
二、登记生效原则的普遍性
尽管合法建造事实物权具有独立性，但不动产物权登记生效原则仍然是物权法律制度中的核心原则。对于不动产的物权变动，如转让、抵押等，必须经过依法登记才能产生法律效力。未经登记，即使当事人之间签订了相关协议或合同，也不能导致物权变动的法律效果。这一原则确保了物权变动的明确性和稳定性，保护了交易双方的合法权益。
三、合法建造事实物权与登记生效原则的衔接
初始取得时的独立性：在房屋合法建造完成时，建造者即取得所有权，无需登记。这是合法建造事实物权的独立性体现。
后续处分时的登记要求：然而，如果建造者想要转让或抵押该房屋，就必须先办理首次登记等手续，将房屋登记到自己名下（如果尚未登记的话），然后再进行转让或抵押登记。这是因为，在涉及物权变动或处分时，必须遵循登记生效原则。未经登记，转让或抵押行为将无法产生法律效力，无法对抗善意第三人。
四、实际案例说明
假设甲在自己的宅基地上合法建造了一栋房屋。房屋建造完成时，甲即取得该房屋的所有权，无需等待办理过户登记。这是合法建造事实物权的独立性体现。然而，如果甲想要将该房屋转让给乙，就必须先办理房屋所有权首次登记（如果尚未登记的话），然后再与乙到不动产登记机构办理房屋所有权转移登记手续。只有完成这些登记手续后，乙才能真正取得该房屋的所有权。
五、法律建议
合法建造时：确保建造行为符合法律法规和规划要求，以便在房屋建造完成时顺利取得所有权。
后续处分时：在涉及物权变动或处分时，务必遵循登记生效原则，及时办理相关登记手续，以确保自己的合法权益得到保护。
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综上所述，合法建造事实物权与登记生效原则在物权法律制度中各自扮演着重要角色。它们既相互独立又相互衔接，共同维护着物权变动的明确性和稳定性。