协议签了备注条件，在符合法律规定的情况下是有效的。以下从不同角度为你详细分析：

备注条件符合法律规定时有效

1. 意思表示真实：如果备注条件是双方当事人在平等、自愿的基础上，真实表达自己的意愿而达成的，那么该备注条件就具有法律效力。例如，甲乙双方签订了一份房屋买卖合同，在合同备注中明确约定了房屋交付的具体时间、交付标准等，且这些约定是双方协商一致的结果，那么该备注条件就是有效的。
2. 不违反法律、行政法规的强制性规定：备注条件的内容必须合法，不能违反国家法律、行政法规的强制性规定。比如，在一份借款合同中，备注条件约定“如果借款人到期不还款，则出借人有权将借款人非法拘禁”，这样的备注条件因为违反了法律关于人身自由的规定，所以是无效的。
3. 不违背公序良俗：公序良俗是指公共秩序和善良风俗。如果备注条件违背了公序良俗，那么该备注条件也是无效的。例如，在一份婚姻协议中，备注条件约定“如果一方提出离婚，则必须净身出户”，这样的约定可能因违背公序良俗（婚姻自由原则）而被认定为无效。

备注条件存在瑕疵时可能无效或部分无效

1. 存在重大误解：如果一方当事人在签订协议时，对备注条件存在重大误解，导致其意思表示不真实，那么该备注条件可能因重大误解而被撤销。比如，甲乙双方签订了一份合作协议，在备注中约定了合作项目的具体收益分配方式，但甲方在签订时对收益分配的计算方式存在重大误解，那么甲方可以在法定期限内请求人民法院或仲裁机构撤销该备注条件。
2. 显失公平：如果备注条件的内容显失公平，即一方当事人利用对方处于危困状态、缺乏判断能力等情形，致使民事法律行为成立时显失公平的，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。例如，在一份买卖合同中，备注条件约定“买方必须承担卖方因本次交易而产生的所有税费”，如果这些税费明显过高，且买方在签订合同时处于不利地位，那么该备注条件可能因显失公平而被撤销。
3. 一方以欺诈、胁迫的手段订立：如果一方当事人以欺诈、胁迫的手段，使对方在违背真实意思的情况下订立的备注条件，受欺诈、胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。比如，在一份借款合同中，出借人以威胁的手段迫使借款人在备注中约定了高额的违约金，那么借款人可以在法定期限内请求撤销该备注条件。

实际应用中的建议

1. 明确备注条件的内容：在签订协议时，如果需要添加备注条件，一定要明确、具体地表述备注条件的内容，避免使用模糊、歧义的语句。
2. 保留相关证据：为了证明备注条件是双方协商一致的结果，以及备注条件的具体内容，建议双方在签订协议时，保留好相关的聊天记录、邮件往来等证据。
3. 及时咨询专业律师：如果你对备注条件的法律效力存在疑问，或者担心备注条件可能存在法律风险，建议及时咨询专业律师，以便得到专业的法律意见和建议。

总之，协议签了备注条件是否有效，取决于备注条件的内容是否符合法律规定。如果你在签订协议或处理合同纠纷时遇到相关问题，可以直接向我咨询。