将农村农田整平建自家院子，这一行为通常是不合法的。以下从多个角度为你详细分析：
法律角度
土地用途管制：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，国家实行土地用途管制制度。农田，特别是基本农田，是受到严格保护的，不得擅自改变用途。将农田整平建院子，显然改变了土地的农业用途，违反了土地用途管制制度。
宅基地使用规定：
- 宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地。如果村民想要建造院子，应当依法申请宅基地，并在宅基地范围内进行建设。未经批准，不得在农田上建造院子。
违法建设的法律后果：
- 如果未经批准擅自将农田整平建院子，可能面临责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状等行政处罚。如果情节严重，还可能构成非法占用农用地罪，面临刑事处罚。
实际操作角度
申请宅基地：
- 如果村民确实需要建造院子，应当依法向当地土地管理部门申请宅基地。申请时需要提供相关证明材料，如身份证明、土地权属证明等。
遵守建设规划：
- 在获得宅基地使用权后，村民还需要遵守当地的建设规划，按照规定的标准进行建设。不得擅自扩大建设范围或改变建设用途。
环保与生态保护：
- 在建设过程中，还需要注意环保与生态保护，避免对周围环境造成破坏。例如，不得随意砍伐树木、破坏植被等。
特殊情况说明
- 如果农田因为自然灾害等原因确实无法继续用于农业生产，且符合当地土地利用总体规划和城乡规划，那么经过相关部门的批准后，可能可以将其转化为建设用地用于建造院子。但这种情况非常特殊，且需要严格的审批程序。
建议：如果你确实有在农村建造院子的需求，建议你先了解当地的土地政策和建设规划，依法申请宅基地，并按照规定的标准进行建设。如果你对相关法律政策不了解或有疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。