初三休年假本身不会影响加班费的计算与发放。下面我将从加班费的计算依据、年休假与加班费的关系等角度为你详细解释：

加班费的计算依据

根据《劳动法》第四十四条的规定，加班费是根据劳动者加班的具体情况来计算的，具体分为以下三种情形：

1. 工作日延时加班：用人单位安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬。
2. 休息日加班：休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬。
3. 法定节假日加班：法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的300%的工资报酬，且不得安排补休。

年休假与加班费的关系

年休假是劳动者依法享有的休息权利，其工资报酬的计算与加班费是独立的。根据《职工带薪年休假条例》和《企业职工带薪年休假实施办法》的规定，对职工应休未休的年休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬，其中已包含了单位支付职工正常工作期间的工资收入，即另外再支付2倍的工资。但这与加班费的计算没有直接关系。

初三休年假的特殊情况

初三作为法定节假日（春节假期的一部分），如果劳动者选择在这一天休年假，实际上是在享受其依法应得的休息权利。这一天如果原本就是法定节假日，那么劳动者即使不休年假，用人单位也需要支付300%的工资报酬作为法定节假日的加班费（如果劳动者被安排工作的话）。而如果劳动者选择休年假，则这一天不会计入加班时间，因此也不会产生加班费的问题。但重要的是，休年假本身并不会影响劳动者在其他时间因加班而应得的加班费。

总结与建议

1. 加班费计算独立：加班费的计算是基于劳动者实际加班的时间和情况，与是否休年假无关。
2. 依法享受年休假：劳动者应依法享受年休假，这是其合法的休息权利。
3. 保留加班证据：如果劳动者在节假日或休息日被安排加班，应保留好相关证据（如加班通知、考勤记录等），以便在需要时维护自己的合法权益。

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