结论：关于“厂房是租户搭建的，租期为十五年是否合法”这一问题，不能一概而论，需要从多个角度进行分析，包括租赁合同的约定、搭建行为的合法性以及租赁期限的合法性等。
租赁合同约定角度：
- 如果租赁合同中明确约定了租户可以在租赁期内搭建厂房，并且双方对搭建物的归属、使用、拆除等事项有明确的约定，那么这种约定在双方自愿、平等、公平的基础上是有效的。但需要注意的是，这种约定不能违反法律法规的强制性规定，也不能损害国家、集体或第三人的利益。
搭建行为合法性角度：
- 租户搭建厂房的行为必须合法。这包括但不限于：搭建行为必须符合当地的城乡规划、土地利用规划等相关规定；搭建厂房必须取得相应的建设许可或审批手续；搭建过程中必须遵守安全生产、环境保护等法律法规。如果搭建行为违法，那么即使租赁合同中有相关约定，也可能因违法而无效。
租赁期限合法性角度：
- 关于租赁期限，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。因此，如果租赁合同中约定的租期为十五年，且没有违反其他法律法规的强制性规定，那么这个租期是合法的。但需要注意的是，如果租赁期限届满后，双方继续履行租赁合同的，视为不定期租赁，当事人可以随时解除合同，但应当在合理期限之前通知对方。
进一步分析：
- 在实际操作中，还需要考虑租赁物的性质、用途以及双方当事人的具体情况等因素。例如，如果租赁物是国有土地上的厂房，那么搭建行为可能需要经过国有土地管理部门的审批；如果租赁物是农村集体土地上的厂房，那么搭建行为可能需要符合农村集体土地使用的相关规定。
- 此外，如果租赁合同中约定了租户搭建厂房后，搭建物的归属问题，那么这也可能影响到租赁期限的合法性以及双方当事人的权益。例如，如果约定搭建物归出租人所有，那么租户在租赁期满后可能需要拆除搭建物或将其无偿转让给出租人；如果约定搭建物归租户所有，那么租户在租赁期满后可能需要与出租人协商处理搭建物的归属问题。
建议：
- 在签订租赁合同时，双方应当明确约定租赁物的现状、使用目的、租赁期限、租金及支付方式、搭建物的归属及处理方式等事项，以避免后续产生纠纷。
- 如果租户计划在租赁期内搭建厂房，应当事先了解并遵守相关法律法规的规定，取得必要的建设许可或审批手续，确保搭建行为的合法性。
- 在租赁期限内，双方应当按照租赁合同的约定履行各自的义务，维护租赁关系的稳定。如果发生纠纷或争议，应当及时通过协商、调解或诉讼等方式解决。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。