结论：在刑事案件中，手机被扣押后，车子是否会被扣押取决于多种因素，包括案件性质、车辆与案件的关联性以及执法机关的判断等。
分析说明：
案件性质与车辆关联性：
- 在交通运输相关的刑事案件中，如果车辆是作案工具，如用于运输违禁品、逃逸等，那么车辆很可能会被扣押作为证据。
- 如果车辆与案件无直接关联，或者只是作为普通交通工具使用，那么车辆被扣押的可能性就相对较小。
执法机关的判断与程序：
- 执法机关在扣押物品时，会依据相关法律法规和案件具体情况进行判断。他们会考虑物品是否与案件有关、是否需要作为证据使用等因素。
- 扣押车辆需要遵循一定的法律程序，如出具扣押决定书、告知当事人权利等。如果执法机关认为车辆需要扣押，他们会按照法定程序进行。
可能的法律后果：
- 如果车辆被扣押，车主有权了解扣押的原因和期限，并可以在必要时提出异议或申请复议。
- 在案件处理完毕后，如果车辆被证明与案件无关或不再需要作为证据使用，执法机关应当及时返还车辆。
特殊场景：
- 在某些特殊情况下，如车辆涉及重大刑事案件、车辆本身存在安全隐患或需要进一步调查等，执法机关可能会决定扣押车辆，即使车辆与案件的直接关联性不强。
行动建议：
- 如果您的手机被扣押，且担心车辆也可能被扣押，建议您首先了解案件的具体情况和执法机关的扣押决定。
- 如果您认为车辆与案件无关或不应被扣押，您可以向执法机关提出异议，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 在整个过程中，保持与执法机关的沟通，并配合他们的调查工作，以便尽快解决问题。
如果您有任何进一步的法律问题或需要更具体的建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答。