结论：两个帮忙收工程的人之间的工程款单方付清确认，其法律效力需根据具体情况判断，若确认行为损害第三方利益，则可能无效或可撤销。以下从法律效力、损害第三方利益的情况及法律后果等角度进行详细分析。
一、法律效力分析
合同相对性原则：
- 工程款支付确认通常涉及合同双方，即发包方和承包方（或实际施工人）。若两个帮忙收工程的人并非合同当事人，他们之间的单方付清确认，从合同相对性原则出发，原则上对合同双方不产生直接法律效力。
- 但若该确认行为得到了合同双方的认可或追认，或者该确认行为是合同双方授权或委托下的行为，则可能具有法律效力。
表见代理或职务行为：
- 如果其中一个帮忙收工程的人在确认行为时，被第三方合理认为其具有代表合同一方进行确认的权限（如表见代理），或者其行为属于职务行为，则该确认行为可能对合同双方产生法律效力。
自愿与公平原则：
- 即使确认行为不直接涉及合同双方，但如果双方均自愿接受该确认结果，且该结果不违反公平原则，那么该确认行为在双方之间可能具有法律效力。
二、损害第三方利益的情况及法律后果
损害第三方利益的情况：
- 若两个帮忙收工程的人之间的单方付清确认，导致合同一方未能按照约定获得应得的工程款，或者导致第三方（如其他债权人）的利益受损，则该确认行为可能因损害第三方利益而无效或可撤销。
法律后果：
- 无效：根据《民法典》的相关规定，恶意串通，损害国家、集体或者第三人利益的民事法律行为无效。因此，如果确认行为存在恶意串通损害第三方利益的情况，该行为将被认定为无效。
- 可撤销：如果确认行为是在一方受欺诈、胁迫等情况下作出的，且损害了第三方利益，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该行为。
三、建议与措施
核实身份与权限：
- 在进行工程款支付确认时，务必核实确认人的身份和权限，确保其行为代表合同一方或得到合同一方的授权。
保留证据：
- 保留与工程款支付相关的所有证据，包括合同、支付凭证、确认文件等，以便在发生纠纷时提供有力支持。
及时咨询与处理：
- 如果发现确认行为可能损害第三方利益或存在其他法律问题，应及时咨询专业律师，并采取相应措施防止损失扩大。
四、举例说明
假设A和B是帮忙收工程的两个人，他们之间单方确认工程款已付清，但该确认行为并未得到合同发包方C的认可，且实际上C尚未支付全部工程款给承包方D。在此情况下，如果D因此未能获得应得的工程款，D可以主张A和B之间的确认行为无效或可撤销，并要求C继续支付工程款。
总结：两个帮忙收工程的人之间的工程款单方付清确认，其法律效力需根据具体情况判断。若确认行为损害第三方利益，则可能无效或可撤销。因此，在进行此类确认时，务必谨慎行事，并咨询专业律师的意见。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。