挂靠公司车辆内部转让协议不建议私下签订，以下从多个角度为你详细分析：

法律合规性角度

1. 公司内部管理规定：许多公司对于车辆等重要资产的管理有严格的内部规定。即使车辆是挂靠在公司名下，公司可能出于资产安全、税务筹划、风险防控等多方面的考虑，对车辆的转让设定了特定的流程和审批机制。如果私下签订转让协议，可能违反公司的内部管理规定，导致转让行为无效，甚至可能引发公司内部的纪律处分。
2. 法律法规要求：车辆转让涉及到物权的变动，根据《民法典》等相关法律法规的规定，物权的设立、变更、转让和消灭，应当依照法律规定登记。对于挂靠在公司名下的车辆，其所有权可能登记在公司名下，私下签订转让协议而不进行相应的变更登记，可能无法对抗善意第三人，给双方带来法律风险。例如，如果原挂靠人（卖方）在转让车辆后，又以车辆所有权人的身份进行其他法律行为，如抵押、出售等，可能会给受让方（买方）造成损失。

税务角度

1. 税务申报与缴纳：车辆转让通常涉及到增值税、个人所得税等税费的申报与缴纳。私下签订转让协议，可能无法准确核算转让收入，导致税费申报不实，从而面临税务机关的处罚。例如，如果转让价格明显低于市场价格，税务机关可能会按照市场价格核定转让收入，要求补缴相应的税费及滞纳金。
2. 发票开具问题：正规的车辆转让应当开具合法的发票，作为交易凭证和税务申报的依据。私下签订转让协议，可能无法获得合法的发票，这不仅会影响受让方的财务核算，还可能在后续的车辆使用、处置等环节带来麻烦。

风险防控角度

1. 合同效力风险：私下签订的转让协议可能因缺乏必要的条款或形式要件而存在合同效力风险。例如，如果协议中没有明确约定车辆的质量状况、交付时间、违约责任等重要条款，一旦发生纠纷，双方可能难以通过协议来维护自己的权益。
2. 潜在纠纷风险：车辆转让可能涉及到诸多潜在纠纷，如车辆存在质量问题、交通事故责任承担、违章处理等。私下签订转让协议，可能无法对这些潜在纠纷进行充分的约定和防范，导致双方在纠纷发生后陷入漫长的法律诉讼程序，耗费大量的时间和精力。

实际操作建议

1. 遵循公司流程：如果确实需要进行挂靠公司车辆的内部转让，建议首先了解公司的内部管理规定和流程，按照规定的要求进行申请和审批。在获得公司同意后，再签订正式的转让协议，并进行相应的变更登记手续。
2. 咨询专业律师：在签订转让协议前，建议咨询专业律师的意见，确保协议的内容合法、合规、有效。律师可以根据双方的具体情况和需求，起草或审查转让协议，明确双方的权利义务，防范潜在的法律风险。
3. 办理变更登记：在签订转让协议并获得公司同意后，应及时到相关部门办理车辆的变更登记手续，将车辆的所有权变更至受让方名下。这不仅可以确保受让方的合法权益，还可以避免后续可能出现的法律纠纷。

如果你有关于公司法务方面的其他问题，也可以直接向我咨询。