在虚开增值税专用发票罪中，所指的“税款”主要关联到增值税这一税种，以及该税种专用发票的抵扣功能所涉及的税款金额。下面我将从几个方面详细解释这一概念：
一、增值税专用发票的抵扣功能
增值税专用发票是商事活动中重要的完税凭证，它不仅证明了销货方的纳税义务，也作为购货方进项税额的合法证明。在增值税的征管体系中，购货方可以凭借合法有效的增值税专用发票，将其上的税额作为进项税额进行抵扣，从而减少其应缴纳的增值税额。
二、虚开增值税专用发票与税款的关系
虚开增值税专用发票罪，是指为他人虚开、为自己虚开、让他人为自己虚开、介绍他人虚开增值税专用发票，或者用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的行为。这些行为的核心在于，它们都涉及到了对增值税专用发票抵扣功能的滥用，进而可能导致国家税款的流失。
为他人虚开：行为人明知他人没有真实的货物购销或应税劳务，却为其开具增值税专用发票，使得他人能够利用这些发票进行税款抵扣，从而骗取国家税款。
为自己虚开：行为人在没有真实货物购销或应税劳务的情况下，为自己开具增值税专用发票，以虚增进项税额，减少应纳税额，同样造成国家税款的流失。
让他人为自己虚开：行为人通过要求他人为自己开具数量或金额不实的增值税专用发票，或者让他人代开增值税专用发票，以达到骗取税款的目的。
介绍他人虚开：行为人在虚开增值税专用发票的双方之间牵线搭桥，促成虚开行为的完成，同样构成对国家税款的侵害。
三、法律后果与税款数额
根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，虚开增值税专用发票罪的法律后果与虚开的税款数额紧密相关。虚开的税款数额越大，或者存在其他严重情节，如多次虚开、造成国家税款重大损失等，行为人所面临的刑事处罚也就越严厉。这包括有期徒刑、拘役以及罚金等处罚措施，甚至可能面临没收财产的极端处罚。
综上所述，虚开增值税专用发票罪中的“税款”主要指的是增值税这一税种，以及因虚开行为而可能导致的国家税款的流失。这一罪名的设立和处罚，旨在维护国家税收管理制度和税收征管秩序，保护国家税收利益不受侵害。