针对“阴阳合同拒付工程款”这一问题，核心结论是：可以通过协商、诉讼或仲裁等法律途径解决，关键在于证明实际履行的合同内容及工程款金额。以下是具体分析：

1. 明确阴阳合同的性质及效力
   阴阳合同通常指双方就同一事项签订两份内容不一致的合同，一份对外（如备案合同），一份对内（实际履行合同）。根据《民法典》第146条，若阴阳合同中“阳合同”（对外合同）并非双方真实意思表示，而“阴合同”（对内合同）是真实意思表示，则以“阴合同”为准。但若“阴合同”因恶意串通损害第三方利益（如逃避税费、规避监管），可能被认定无效，此时需按法律规定或行业惯例确定工程款。

2. 收集证据证明实际履行情况
   若“阴合同”有效，需重点收集以下证据：

   • 实际履行合同的文本、补充协议、会议纪要等；
     
   • 工程进度款支付记录、发票、收据等财务凭证；
     
   • 施工过程中的签证单、变更单、验收报告等工程文件；
     
   • 双方沟通记录（如邮件、微信、录音）中关于合同内容的确认。
     这些证据需形成完整链条，证明双方实际按“阴合同”履行，而非“阳合同”。

3. 通过法律途径主张权利

   • 协商：优先与对方沟通，明确拒付原因（如对工程量、质量有异议），尝试达成补充协议或分期付款方案。
     
   • 诉讼/仲裁：若协商无果，可向法院起诉或按合同约定申请仲裁。起诉时需明确诉讼请求（如支付工程款及利息、违约金），并围绕“阴合同”的有效性及实际履行情况举证。若“阴合同”无效，则需按《民法典》第793条（建设工程施工合同无效但工程验收合格的，可参照合同关于工程价款的约定折价补偿）主张权利。
     
   • 财产保全：为防止对方转移资产，可在起诉时申请财产保全，冻结其银行账户、房产等财产。

4. 注意诉讼时效与举证期限
   工程款纠纷的诉讼时效为3年，自应付款之日起算。若对方以“阴合同”无效抗辩，需在举证期限内提交反证（如“阴合同”存在恶意串通的证据）。若涉及工程质量问题，对方可能主张抵销或反诉，需提前准备应对方案。

建议：阴阳合同风险较高，建议未来签订合同时确保内容合法、条款明确，并保留完整履行证据。若已产生纠纷，可进一步向我提供合同文本、履行凭证等材料，以便更精准地分析案件走向。