单位发现员工虚假申报职称的，应当根据内部规章制度和法律规定，结合具体情况采取相应处理措施，具体处理方式如下：

1. 核实事实与证据收集
   单位需首先通过调查核实员工是否存在虚假申报行为，例如核查职称证书真伪、申报材料中的学历、工作经历、业绩成果等是否属实。可要求员工提供原始证明材料，或通过第三方机构（如发证机关、学校、前单位）进行核实。若发现材料造假，应固定证据（如书面材料、聊天记录、证人证言等），为后续处理提供依据。

2. 依据内部规章制度处理
   若单位《员工手册》《劳动合同》或相关制度中明确规定“虚假申报职称属于严重违纪行为”，可依据制度对员工进行处分。常见处理方式包括：

   • 警告或记过：适用于情节较轻、未造成严重后果的情况；
     
   • 解除劳动合同：若虚假申报行为严重违反诚信原则，或导致单位遭受损失（如错失项目资质、支付额外薪酬等），单位可依据《劳动合同法》第39条，以“严重违反用人单位规章制度”为由解除合同，且无需支付经济补偿。
     注意：单位需确保规章制度已通过民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示，否则可能因程序瑕疵导致处分无效。

3. 追偿损失与法律责任
   若员工虚假申报导致单位遭受经济损失（如因职称不符被取消项目资格、支付高额补贴等），单位可要求员工赔偿。根据《民法典》第1165条，员工需承担过错赔偿责任，单位可通过协商、调解或诉讼追偿。
   若虚假申报涉及伪造国家机关证件（如伪造职称证书），可能触犯《刑法》第280条，单位可向公安机关报案，追究员工刑事责任。

4. 后续管理建议

   • 完善申报审核流程：建立职称申报材料交叉核验机制，要求员工签署诚信承诺书；
     
   • 定期复核资质：对已取得职称的员工定期抽查，防止“持证造假”；
     
   • 加强法律培训：通过案例警示员工虚假申报的法律后果，降低风险。

温馨提示：单位处理此类问题时需兼顾“合法性”与“合理性”，避免因处分过当引发劳动争议。若对证据效力或处分程序存疑，可直接向我咨询，我会结合具体案情提供操作建议。