结论前置：在交警的现场指挥下闯红灯，即使被电子监控设备拍摄到，也不属于违法行为，不会被认定为违章而遭受处罚。若因此收到违章记录，驾驶员有权进行申诉或行政复议以撤销该记录。
一、法律依据与原理分析
根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，我们可以明确以下几点：
《道路交通安全法》第四十四条：机动车通过交叉路口时，应当按照交通信号灯、交通标志、交通标线或者交通警察的指挥通过。这意味着，在交警现场指挥的情况下，交警的指挥具有最高优先级。
《道路交通安全法》第三十八条：车辆、行人应当按照交通信号通行；遇有交通警察现场指挥时，应当按照交通警察的指挥通行。这进一步强调了交警现场指挥的权威性。
二、具体处理方式与步骤
保留证据：
- 如果在交警指挥下闯红灯，建议尽可能保留相关证据，如现场照片、行车记录仪视频等。这些证据需清晰展示交警的指挥动作、信号灯状态及你的车辆行驶情况，以便后续申诉或行政复议时使用。
提交申诉或行政复议：
- 前往交警大队：携带驾驶证、行驶证及相关证据，亲自前往当地负责交通管理的交警大队，向工作人员说明情况并提交申诉材料。
- 网上申诉：如所在地支持网上申诉，可登录交通管理部门官方网站或相关APP，按指引完成申诉流程并上传证据。
- 行政复议：作为另一种选择，可向交警支队法制科提交行政复议申请，同样需附带详尽的证据资料。行政复议的期限一般为知道该具体行政行为之日起60日内。
等待审核与处理：
- 交通管理部门将对提交的申诉或复议材料进行审核，过程中可能会调取现场监控录像进行核实。审核周期通常为数个工作日至十数个工作日不等。
结果反馈与后续操作：
- 申诉/复议成功：若证据充分且合规，交通管理部门将撤销违章记录，不会对你进行任何处罚。
- 申诉/复议失败：若因证据不足或其他原因未能通过，你可进一步了解失败原因，考虑补充证据后再次申诉或接受相应处罚。
三、注意事项与特殊情况处理
证据的重要性：
- 无论采取何种方式申诉，确凿的证据都是关键。务必确保提交的材料能够清晰、准确地反映当时的情况。
熟悉交通规定：
- 了解并遵守当地的交通规则，特别是在遇到交警指挥与信号灯不一致时，应以交警指挥为准。这是每位驾驶员应尽的义务，也是保障道路交通安全的基础。
积极配合调查：
- 在处理过程中，应保持冷静并积极配合交通管理部门的调查工作。如实陈述事实，提供必要的协助，有助于加快处理进度并维护你的合法权益。
特殊情况处理：
- 如果因为服从交警的现场指挥而被拍照记录了闯红灯的行为，且未收到违法通知，但担心后续可能出现问题，你可以主动到事发地的交警大队开具证明，证实当时是按照交警的指挥通行。这样，即可免于潜在的处罚风险。
四、总结与建议
在遇到交警指挥与信号灯不一致的情况时，务必遵循交警的指挥，并确保记录下关键证据。若因此收到违法通知或担心后续可能出现问题，及时与交通管理部门沟通并提出申诉或行政复议是维护自己合法权益的有效途径。同时，也提醒广大驾驶员朋友，无论何时何地，都应尊重并遵守交警的指挥，以确保道路交通安全与顺畅。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。