当交警在执勤时，若因交警的指挥而闯红灯，这种情况是有特殊处理方式的，您不必过于担心。以下是根据相关法律法规和实际操作流程，为您提供的详细解答：
一、法律依据与结论
根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车在通过交叉路口时，应当遵循交通信号灯、交通标志、交通标线或交通警察的指挥。特别地，当遇到交通警察现场指挥时，车辆和行人应当按照交通警察的指挥通行。因此，在交警的现场指挥下闯红灯，即使被电子监控设备拍摄到，也不属于违法行为，不会被认定为违章而遭受处罚。
二、若因此收到违章记录，您应如何处理
保留证据：
- 您需要收集并保留所有能证明您是在交警指挥下通过路口的证据。这些证据可以包括现场照片、行车记录仪视频等，它们需清晰展示交警的指挥动作、信号灯状态以及您的车辆行驶情况。
提交申诉或行政复议：
- 前往交警大队：您可以携带驾驶证、行驶证以及相关证据，亲自前往当地负责交通管理的交警大队。向工作人员详细说明情况，并提交您的申诉材料。
- 网上申诉：如果所在地支持网上申诉，您也可以登录交通管理部门的官方网站或相关APP，按照指引完成申诉流程，并上传您的证据。
- 行政复议：作为另一种选择，您还可以向交警支队法制科提交行政复议申请，同样需要附带详尽的证据资料。
等待审核与处理：
- 交通管理部门将对您的申诉或复议材料进行审核。在这个过程中，他们可能会调取现场的监控录像进行核实。审核周期通常为数个工作日至十数个工作日不等，请您耐心等待。
结果反馈与后续操作：
- 申诉/复议成功：如果您的证据充分且合规，交通管理部门将撤销您的违章记录，您不会受到任何处罚。
- 申诉/复议失败：如果因证据不足或其他原因未能通过申诉或复议，您可以进一步了解失败的原因，考虑补充证据后再次申诉，或者接受相应的处罚。
三、注意事项
- 证据的重要性：无论您选择哪种方式申诉，确凿的证据都是关键。请务必确保您提交的材料能够清晰、准确地反映当时的情况。
- 熟悉交通规定：了解并遵守当地的交通规则是非常重要的。特别是在遇到交警指挥与信号灯不一致时，您应以交警的指挥为准。
- 积极配合调查：在处理过程中，请保持冷静并积极配合交通管理部门的调查工作。这将有助于加快处理速度并提高申诉成功的几率。
综上所述，当您在交警的指挥下闯红灯并被拍摄到时，只要您遵循上述处理指南，提供充分的证据进行申诉或行政复议，您的违章记录将被撤销，您不会受到任何处罚。同时，也请您在驾驶过程中始终尊重并遵守交警的指挥，以确保道路交通安全与顺畅。