当您在红灯亮起时，遇到交警指挥通行的情况，首先请放心，按照交警的指挥通行并不构成闯红灯的违法行为，也不会因此受到处罚。这是基于《中华人民共和国道路交通安全法》的明确规定，该法第三十八条指出，遇有交通警察现场指挥时，车辆、行人应当按照交通警察的指挥通行。

具体处理方式与步骤

1. 当场行动：

   • 服从指挥：首要的是立即按照交警的指挥行动，确保交通流畅和安全。
   • 留存证据：在条件允许且不影响交通秩序的前提下，通过拍照、录像等方式记录下当时的场景，包括交警的指挥动作、交通信号灯的状态以及周围的交通情况。这些证据在后续可能遇到的任何问题中都将起到关键作用。

2. 事后处理：

   • 若未收到违章通知：则无需进一步行动，因为您的行为是合法的。
   • 若收到违章通知：
     • 准备申诉材料：携带驾驶证、行驶证以及之前留存的证据（如照片、视频等），这些材料将用于证明您是在交警的指挥下通行的。
     • 提交申诉：

          - **前往交警大队**：亲自前往当地负责交通管理的交警大队，向工作人员说明情况并提交申诉材料。
          - **网上申诉**：如果所在地支持网上申诉，可以登录交通管理部门官方网站或相关APP，按照指引完成申诉流程并上传证据。
       

     • 行政复议：如果对申诉结果不满意，还可以向交警支队法制科提交行政复议申请，同样需附带详尽的证据资料。

3. 等待审核与处理：

   • 交通管理部门将对提交的申诉或复议材料进行审核，过程中可能会调取现场监控录像进行核实。审核周期通常为数个工作日至十数个工作日不等。

4. 结果反馈与后续操作：

   • 申诉/复议成功：若证据充分且合规，交通管理部门将撤销违章记录，不会对您进行任何处罚。
   • 申诉/复议失败：若因证据不足或其他原因未能通过，您可以进一步了解失败原因，考虑补充证据后再次申诉或接受相应处罚。

注意事项

• 证据的重要性：无论采取何种方式申诉，确凿的证据都是关键。务必确保提交的材料能够清晰、准确地反映当时的情况。
• 熟悉交通规定：了解并遵守当地的交通规则，特别是在遇到交警指挥与信号灯不一致时，应以交警指挥为准。
• 积极配合调查：在处理过程中，应保持冷静并积极配合交通管理部门的调查工作。

综上所述，当您在红灯亮起时遇到交警指挥通行的情况，只需按照交警的指挥行动，并留存好相关证据即可。若因此收到违章通知，也无需担心，通过合法的申诉或行政复议途径，您的违章记录将被撤销。