结论：在承包合同中，“乙方所有费用自理”这一条款是否包括房租，主要取决于合同的具体内容、双方的真实意图以及相关法律法规的规定。一般情况下，如果合同中没有明确排除房租，那么该条款很可能包括房租。以下是对此问题的详细分析：
一、合同条款的解读
字面意思：从字面上看，“乙方所有费用自理”意味着乙方需要承担所有与合同履行相关的费用。如果房租是合同履行过程中必然产生的费用，且合同中没有明确排除，那么按照字面意思，乙方应当承担房租。
合同整体解释：在解读合同条款时，需要遵循合同整体解释的原则。即，不能仅看单个条款，而应将合同作为一个整体来解读。如果合同中其他条款或附件对“所有费用”有具体说明或列举，且未将房租排除在外，那么乙方应当承担房租。
二、双方真实意图的推断
交易习惯：在商业实践中，交易习惯是推断双方真实意图的重要依据。如果双方在过去的交易中或同类交易中，通常将房租视为乙方应承担的费用，那么在没有相反约定的情况下，可以推断双方在此次合同中也具有相同的意图。
合同目的：合同的目的是双方签订合同所追求的目标。如果房租是合同目的实现所必需的费用，且合同中没有明确排除，那么可以推断乙方应当承担房租。
三、相关法律法规的规定
《民法典》的相关规定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同的内容由当事人约定，一般包括当事人的姓名或者名称和住所、标的、数量、质量、价款或者报酬、履行期限、地点和方式、违约责任、解决争议的方法等条款。在解读合同条款时，应遵循公平、诚实信用等原则。如果“乙方所有费用自理”这一条款导致双方权利义务明显失衡，可能违反公平原则，此时法院或仲裁机构可能根据具体情况进行调整。
行业惯例：在某些行业中，可能存在特定的行业惯例或交易习惯。如果这些惯例或习惯与合同条款的解读相关，且双方均知晓并同意遵循，那么它们也可以作为推断双方真实意图的依据。
四、建议与风险提示
明确合同条款：为了避免争议，建议在合同中明确约定“乙方所有费用自理”是否包括房租。如果包括，可以进一步明确房租的支付方式、支付时间等具体事项。
保留相关证据：在合同履行过程中，双方应保留与房租支付相关的证据，如租金发票、转账记录等。这些证据在发生争议时可能起到关键作用。
寻求法律帮助：如果双方对合同条款的解读存在争议，且无法通过协商解决，可以寻求法律帮助。律师可以根据合同的具体内容、双方的真实意图以及相关法律法规的规定，为双方提供专业的法律意见。
最后，如果你在房产租赁或合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律服务。